一种桑叶品种鉴定的双分子标记方法与流程

专利2026-08-25  25


本发明属于中医药,具体涉及一种桑叶品种鉴定的双分子标记方法。


背景技术:

1、

2、我国桑种质资源已达上千种,且有逐年增多趋势。桑树在长期进化选择和被选择过程中,逐步演化出农艺性状、生理代谢、化学成分等方面的遗传多样性,进而表达为药理毒理、品质内涵的异同。国内外学者通过issr(inter-simple sequence repeat)、alfp(amplified frag-ment length polymorphism)、ssr(simple sequence repeat)等分子标记技术解析桑种质资源间的遗传多样性,揭示了桑种质资源间的亲缘关系与地理分布、生态型、起源、产量形状具有显著相关性,但目前尚未见桑叶遗传多样性与药理作用、化学成分之间相互关系的研究报道。

3、故本研究采集了69份山东主栽品种,首次建立了可以表征疏散风热功效偏向性的双分子鉴别体系。通过对其解热作用进行分析,构建了ssr和uplc-ms指纹图谱,分别从药效、分子、化学水平揭示了品种之间解热作用、遗传结构、化学成分的多样性和相关性,筛选了一套包含7个ssr位点的核心标记组合,指认了桑叶具有药效偏向性的“化学-分子”双分子标记物,为桑叶疏散风热功效偏向性品种的选育提供重要遗传资源,同时,也为桑叶品种鉴定、药用价值深度应用提供了技术支持。


技术实现思路

1、本发明以山东省桑主栽品种为研究对象,构建69份不同品种桑叶的ssr/uplc-ms双指纹图谱和解热作用聚类图,比较解热作用、遗传结构、化学成分差异性,分析“药效-分子-成分”相关性。通过研究,确定ssr/uplc-ms双指纹图谱最终筛选分子标记物为一套包含7个ssr位点的核心标记组合,化学标记物为隐绿原酸、新绿原酸、异槲皮苷、芦丁、水杨酸、伞形花内酯、烟花苷、紫云英苷,确定了具有疏散风热功效药效偏向性的“化学-分子”双分子标记物。

2、首先,从分子层面,筛选到的一套包含7个ssr位点的核心标记组合,可作为桑叶品种鉴别的分子标记物;再者,从化学成分层面,筛选到的隐绿原酸、新绿原酸、异槲皮苷、芦丁、水杨酸、伞形花内酯、烟花苷、紫云英苷,可作为桑叶品种鉴别的化学标记物,相比之前的单层面鉴别方法,本发明建立的双分子标记物可从分子和化学两个层面鉴别桑叶品种。另外,本发明还有一个特点,本发明确定的双分子标记物是与功效相关的,是具有疏散风热功效药效偏向性的“化学-分子”双分子标记物,之前报道的标记物要么是单一层面,要么不能体现功效。本发明为创建桑叶品种“药效-分子-成分”的高通量鉴定模式提供参考依据,为推进我国桑叶药用价值精细化、资源高值化利用提供重要支撑。

3、因此本发明提供一种桑树tp-m13-ssr分子标记核心引物组,其特征在于,包括7对ssr分子标记核心引物对和通用m13引物:

4、引物对1:tp1

5、f:5'-cgtggggcttaggctgagtagagg-3'

6、r:5'-caccaccactacttctcttcttccag-3';

7、引物对2:tp2

8、f:5'-ggtcaagcgctccagagaaaag-3'

9、r:5'-ggtgcagaggatgaaagatgaggt-3';

10、引物对3:tp3

11、f:5'-ccccctgcaatgccctctttc-3'

12、r:5'-tgggcgaggcagggaagattc-3';

13、引物对4:tp5

14、f:5'-gccgtgtaccagtggagtttgca-3'

15、r:5'-tgaccgtttcttccactttacctaatg-3';

16、引物对5:tp7

17、f:5'-tccttaggtttttggggtctgtttacat-3'

18、r:5'-cctcattctcctttcacttattgttg-3';

19、引物对6:m2

20、f:5'-cttgggacaaaccattaccg-3'

21、r:5'-aggacatggggattggtgta-3';

22、引物对7:m10

23、f:5'-ctcaggtacgctgtgctg-3'

24、r:5'-gactcaaagcacatgccaag-3';

25、优选地,所有的上游引物的5’端加m13接头:tgtaaaacgacggccagt,m13接头的5’端添加荧光标记(例如fam荧光标记)。

26、具体地,所述的荧光报告基团为fam。

27、本发明还提供一种桑叶品种鉴别的化学标记物组合,其是由隐绿原酸、新绿原酸、异槲皮苷、芦丁、水杨酸、伞形花内酯、烟花苷、紫云英苷的组合。

28、本发明还提供一种疏散风热功效药效偏向性的双分子标记物,其包括如权利要求1或2所述的ssr位点的核心标记组合和如权利要求3所述的化学标记物组合。

29、本发明也提供所述的ssr位点的核心标记组合、所述的化学标记物组合或如权利要求3所述的双分子标记物在桑叶品种鉴别中的应用。

30、具体地,用于鉴定具有疏散风热功效药效偏向性的桑叶品种。

31、本发明还提供一种桑叶品种鉴定的双分子标记方法,其包括如下步骤:

32、s1获取样品基因组dna,采用如权利要求1所述ssr位点的核心标记组合进行扩增;

33、s2获取样品的组织,用如权利要求2桑叶品种鉴别的化学标记物组合进行检测;

34、s3根据s1获得的检测结果,和s2得到检测结果,综合判断桑叶品种。

35、按所述ssr位点的核心标记组合进行扩增,以遗传相似系数0.43为阈值筛选样品,并且隐绿原酸、新绿原酸、异槲皮苷、芦丁、水杨酸、伞形花内酯、烟花苷、紫云英苷为vip大于1的显著性差异成分的样品,即为具有疏散风热功效药效偏向性的桑叶品种。

36、通过研究,确定ssr/uplc-ms双指纹图谱最终筛选分子标记物为一套包含7个ssr位点的核心标记组合,化学标记物为隐绿原酸、新绿原酸、异槲皮苷、芦丁、水杨酸、伞形花内酯、烟花苷、紫云英苷,确定了具有疏散风热功效药效偏向性的“化学-分子”双分子标记物。本发明为创建桑叶品种“药效-分子-成分”的高通量的鉴定模式,为推进我国桑叶药用价值精细化、资源高值化利用提供重要支撑。



技术特征:

1.一种桑树tp-m13-ssr分子标记核心引物组,其特征在于,包括7对ssr分子标记核心引物对和通用m13引物:

2.根据权利要求1所述的桑树ssr分子标记核心引物组,其特征在于,所述的荧光报告基团为fam。

3.一种桑叶品种鉴别的化学标记物组合,其特征在于,其是由隐绿原酸、新绿原酸、异槲皮苷、芦丁、水杨酸、伞形花内酯、烟花苷、紫云英苷的组合。

4.一种疏散风热功效药效偏向性的双分子标记物,其特征在于,其包括如权利要求1或2所述的ssr位点的核心标记组合和如权利要求3所述的化学标记物组合。

5.如权利要求1或2所述的ssr位点的核心标记组合、如权利要求3所述的化学标记物组合或如权利要求4所述的双分子标记物在桑叶品种鉴别中的应用。

6.如权利要求5所述的应用,其特征在于,用于鉴定具有疏散风热功效药效偏向性的桑叶品种。

7.一种桑叶品种鉴定的双分子标记方法,其特征在于,包括如下步骤:


技术总结
本发明以山东省桑主栽品种为研究对象,构建69份不同品种桑叶的SSR/UPLC‑MS双指纹图谱和解热作用聚类图,比较解热作用、遗传结构、化学成分差异性,分析“药效‑分子‑成分”相关性。通过研究,确定SSR/UPLC‑MS双指纹图谱最终筛选分子标记物为一套包含7个SSR位点的核心标记组合,化学标记物为隐绿原酸、新绿原酸、异槲皮苷、芦丁、水杨酸、伞形花内酯、烟花苷、紫云英苷,确定了具有疏散风热功效药效偏向性的“化学‑分子”双分子标记物。本发明为创建桑叶品种“药效‑分子‑成分”的高通量鉴定模式提供参考依据,为推进我国桑叶药用价值精细化、资源高值化利用提供重要支撑。

技术研发人员:郭威,钱丹,王亮,田雨晴
受保护的技术使用者:山东省妇幼保健院
技术研发日:
技术公布日:2024/11/11
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