一种与绵羊产羔数性状相关的SNP分子标记及应用

专利2026-07-23  13


本发明属于基因工程领域,具体涉及一种与绵羊产羔数性状相关的snp分子标记及应用。


背景技术:

1、绵羊是人类的动物蛋白的重要来源之一(goldansaz et al.,2022)。提高绵羊的产羔数对于绵羊养殖具有巨大的经济效益。由于绵羊窝产仔数遗传力低,传统育种方法难以快速提高窝产仔数。因此,探索影响绵羊窝产仔数的候选基因及其各种遗传变异,并将这些变异用于绵羊的分子标记辅助选择(marker-assisted selection,mas)育种,以增加窝产仔数同时提高规模化养殖的生产效率,是目前常用的研究手段(abd el-hack et al.,2018)。

2、unc5c(unc-5netrin receptor c)属于unc-5家族netrin受体成员之一。目前研究表明unc5c和神经发育紧密相关,作为促凋亡分子与其配体netrin-1协同控制轴突迁移。

3、unc5c在人类疾病领域受到广泛研究,主要关于肿瘤癌症以及阿尔兹海默症,近年发现unc5c和多囊卵巢综合征等生殖性状相关。在动物中,unc5c研究成果很有限,有报道发现unc5c突变雄性小鼠的生殖细胞凋亡减少;在荷斯坦奶牛中,unc5c与胚胎发育的受孕率有关,可能影响了胚胎着床前的发育;此外,该基因还和细胞凋亡通路中的基因和子宫内膜异位症相关。在绵羊中还没有任何该基因与繁殖性状相关的报道,在我们前期对绵羊的研究中发现,unc5c在绵羊脑部组织和卵巢、睾丸等性腺组织中显著高表达,其亚细胞定位主要在质膜以及核内。


技术实现思路

1、本发明所要解决的技术问题为:如何提供一种与绵羊产羔数性状相关的snp分子标记,为绵羊产羔数性状测定提供新的分子标记位点。

2、本发明的技术方案为:一种预测绵羊产羔数的方法,对样本绵羊6号染色体第29907419位点或/和第29925629位点的基因型进行检测,参考基因组版本为ars-ui_ramb_v2.0,通过这两个位点基因型进行预测:

3、当第29907419位点基因型为gg或ga时,具有较高的产羔数和产活羔数且gg基因型产羔数和产活羔数高于ga,基因型为aa时,具有较低的产羔数和产活羔数;

4、当第29925629位点的基因型为tt或tc时,具有较高的产羔数和产活羔数且tt基因型产羔数和产活羔数高于tc,基因型为cc时,具有较低的产羔数和产活羔数。

5、检测snp位点基因型的物质在绵羊产羔数性状预测或辅助育种中的应用,所述snp位点有两个,位于绵羊6号染色体,其中一个snp定位于seq id no.1所示核苷酸序列的第149位,具有g/a多态性,另一个snp定位于seq id no.2所示核苷酸序列的第188位,具有t/c多态性。

6、进一步地,所述物质两对引物,其中一对引物的核苷酸序列如seq id no.3和seqidno.4所示,另一对引物的核苷酸序列如seq id no.5和seq id no.6所示。

7、与现有技术相比,本发明具有以下有益效果:

8、本发明公布了绵羊unc5c基因与绵羊产羔数性状相关,发现unc5c基因中的2个snp位点可以做为分子标记进行产多羔性状的分子标记筛选,为进一步研究unc5c基因在绵羊产羔数性状上作用的分子机制奠定基础,为绵羊产羔数性状的标记辅助选择提供新的标记资源。



技术特征:

1.一种预测绵羊产羔数的方法,其特征在于,对样本绵羊6号染色体第29907419位点或/和第29925629位点的基因型进行检测,参考基因组版本为ars-ui_ramb_v2.0,通过这两个位点基因型进行预测:

2.检测snp位点基因型的物质在绵羊产羔数性状预测或辅助育种中的应用,所述snp位点有两个,位于绵羊6号染色体,其中一个snp定位于seq id no.1所示核苷酸序列的第149位,具有g/a多态性,另一个snp定位于seq id no.2所示核苷酸序列的第188位,具有t/c多态性。

3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述物质两对引物,其中一对引物的核苷酸序列如seq id no.3和seq id no.4所示,另一对引物的核苷酸序列如seq id no.5和seqid no.6所示。


技术总结
本发明公开了一种与绵羊产羔数性状相关的SNP分子标记及应用,属于基因工程领域,对样本绵羊6号染色体第29907419位点或/和第29925629位点的基因型进行检测,参考基因组版本为ARS‑UI_Ramb_v2.0,通过这两个位点基因型进行预测:当第29907419位点基因型为GG或GA时,具有较高的产羔数和产活羔数且GG基因型产羔数和产活羔数高于GA,基因型为AA时,具有较低的产羔数和产活羔数;当第29925629位点的基因型为TT或TC时,具有较高的产羔数和产活羔数且TT基因型产羔数和产活羔数高于TC,基因型为CC时,具有较低的产羔数和产活羔数。为绵羊产羔数性状的标记辅助选择提供新的标记资源。

技术研发人员:王海涛,刘泽璇,赵毅强,刘秋月,李亭亭,张娜,黄勋
受保护的技术使用者:中国科学院遗传与发育生物学研究所
技术研发日:
技术公布日:2024/11/11
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