本发明实施例涉及生物学,尤其涉及一种双光子成像数据分析中的细胞提取方法、装置、设备、介质及程序产品。
背景技术:
1、双光子成像是一种特别适合活体动物记录的成像技术。
2、目前,双光子成像仪器一般配备红色和绿色这两个颜色通道。其中,绿色通道一般用来记录细胞的活动信号,该活动信号可以用来得到所有细胞的细胞轮廓;而红色通道一般用来记录标签信号,以此区分特殊类型的细胞。
3、因此,在后期的数据分析中,识别出被标签信号标记的细胞,已成为数据分析中必要的一环。但是,目前无法实现该细胞的准确提取,亟待解决。
技术实现思路
1、本发明实施例提供了一种双光子成像数据分析中的细胞提取方法、装置、设备、介质及程序产品,以实现被标签信号标记的细胞的准确提取。
2、根据本发明的一方面,提供了一种双光子成像数据分析中的细胞提取方法,可以包括:
3、于展示界面上展示标签信号图像,并于标签信号图像上展示细胞轮廓数据,其中,细胞轮廓数据是基于在进行双光子成像后用于记录活动信号的第一通道得到,细胞轮廓数据表征多个细胞轮廓,标签信号图像基于在进行双光子成像后用于记录标签信号的第二通道得到;
4、响应于作用在标签信号图像上的选中操作,可针对多个细胞轮廓中的选中轮廓,于标签信号图像上展示轮廓颜色修改后的选中轮廓;
5、其中,在轮廓颜色由与第一通道对应的第一颜色,修改为与第二通道对应的第二颜色的情况下,选中轮廓所表征的选中细胞被提取。
6、根据本发明的另一方面,提供了一双光子成像数据分析中的细胞提取装置,可以包括:
7、第一展示模块,用于在展示界面上展示标签信号图像,并于标签信号图像上展示细胞轮廓数据,其中细胞轮廓数据基于在进行双光子成像后用于记录活动信号的第一通道得到,细胞轮廓数据表征多个细胞轮廓,标签信号图像基于在进行双光子成像后用于记录标签信号的第二通道得到;
8、第二展示模块,用于响应于作用在标签信号图像上的选中操作,针对多个细胞轮廓中的选中轮廓,于标签信号图像上展示轮廓颜色修改后的选中轮廓;
9、其中,在轮廓颜色由与第一通道对应的第一颜色,修改为与第二通道对应的第二颜色的情况下,选中轮廓所表征的选中细胞被提取。
10、根据本发明的另一方面,提供了一种电子设备,可以包括:
11、至少一个处理器;以及
12、与至少一个处理器通信连接的存储器;其中,
13、存储器存储有可被至少一个处理器执行的计算机程序,计算机程序被至少一个处理器执行,以使至少一个处理器执行时实现本发明任意实施例所提供的双光子成像数据分析中的细胞提取方法。
14、根据本发明的另一方面,提供了一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机指令,该计算机指令用于使处理器执行时实现本发明任意实施例所提供的双光子成像数据分析中的细胞提取方法。
15、根据本发明的另一方面,提供了一种计算机程序产品,其上存储有计算机程序,该计算机程序被处理器执行时实现本发明任意实施例所提供的双光子成像数据分析中的细胞提取方法。
16、本发明实施例的技术方案,通过于展示界面上展示标签信号图像,然后于标签信号图像上展示细胞轮廓数据,该细胞轮廓数据基于在进行双光子成像后用于记录活动信号的第一通道得到,该标签信号图像基于在进行双光子成像后用于记录标签信号的第二通道得到,这样一来,相关人员可于展示界面上同时浏览到标签信号图像和细胞轮廓数据,进而确定出细胞轮廓数据所表征的多个细胞轮廓中对应细胞x(即被标签信号标记的细胞)的细胞轮廓,并在此基础上触发选中操作;响应于作用在标签信号图像上的选中操作,针对多个细胞轮廓中的选中轮廓,可于标签信号图像上展示轮廓颜色修改后的选中轮廓,可以理解的是,在轮廓颜色由与第一通道对应的第一颜色,修改为与第二通道对应的第二颜色的情况下,说明选中轮廓所表征的选中细胞是细胞x,从而被提取出来。上述技术方案,通过交互式的双通道细胞提取过程,实现了双光子成像数据分析中细胞x的准确提取,尤其是实现了双光子成像数据分析中活体动物的细胞x的准确提取。
17、应当理解,本部分所描述的内容并非旨在标识本发明的实施例的关键或是重要特征,也不用于限制本发明的范围。本发明的其它特征将通过以下的说明书而变得容易理解。
1.一种双光子成像数据分析中的细胞提取方法,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,在所述轮廓颜色由所述第二颜色修改为所述第一颜色的情况下,所述选中细胞被取消提取。
3.根据权利要求1或是2所述的方法,其特征在于,所述第一通道是绿色通道,所述第一颜色是绿色;所述第二通道是红色通道,所述第二颜色是红色。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,在所述于所述标签信号图像上展示细胞轮廓数据之后,还包括:
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,还包括:
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,在所述于所述标签信号图像上展示细胞轮廓数据之前,还包括:
7.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,进行所述双光子成像的成像样本是活体动物。
8.一种双光子成像数据分析中的细胞提取装置,其特征在于,包括:
9.一种电子设备,其特征在于,包括:
10.一种计算机可读存储介质,其特征在于,所述计算机可读存储介质存储有计算机指令,所述计算机指令用于使处理器执行时实现如权利要求1-7中任一所述的双光子成像数据分析中的细胞提取方法。
11.一种计算机程序产品,其特征在于,所述计算机程序产品包括计算机程序,所述计算机程序在被处理器执行时实现如权利要求1-7中任一项所述的双光子成像数据分析中的细胞提取方法。
