一种基于ssDNA-(6,5)-SWCNT的pH近红外检测方法及其应用与流程

专利2026-01-02  12


本发明属于生物传感器,具体涉及一种基于ssdna-(6,5)-swcnt的ph近红外检测方法及其应用。


背景技术:

1、ph值是细胞内外环境的重要参数之一,与细胞增殖、凋亡、内吞作用、离子运输等关键生物过程密切相关。ph值的异常通常与生物体功能紊乱有关,对生物体内的生物化学反应、蛋白质构象和酶活性等产生重要影响。准确、快速地检测ph值对于生物医学研究、药物开发以及环境监测等领域至关重要。

2、cn109211851a公开了一种基于铜锌锡硫合金量子点的ph检测方法,铜锌锡硫合金量子点采用铜盐、锌盐、亚锡盐的低毒金属盐类化合物,高分子聚合物作为包覆稳定剂,滴加硫脲在水热条件下合成出铜锌锡硫合金量子点,随包覆剂的比例增加,发射波长可逐渐从紫外光区移向蓝光区域和可见光区域。在进行ph检测时,以铜锌锡硫合金量子点为荧光标记物,以使检测体系的荧光强度淬灭,即ph与荧光强度呈现线性淬灭关系,对比标准曲线,即可得到待测体系的ph。

3、过去几十年里,出现多种ph检测方法,如玻璃电极、光谱法、电化学等,但上述方法容易受到外界干扰,且操作较复杂。

4、核酸,作为生物体内的大分子,具有独特的结构和序列,通过改造和修饰核酸的分子结构和功能,可以赋予核酸探针良好的稳定性、选择性和灵敏度。核酸功能化的荧光探针利用核酸特异的结构和序列,可应用于复杂的生物体系中进行实时、无损的ph监测,成为ph检测领域的热点之一。因此,开发一种用于ph监测的核酸功能化的荧光探针具有重要的应用价值。


技术实现思路

1、针对现有技术存在的不足,本发明的目的在于提供一种基于ssdna-(6,5)-swcnt的ph近红外检测方法及其应用。所述检测方法在6.00-9.00的ph范围内,荧光探针的荧光强度变化与ph变化具有良好的相关性。在此ph区间内,荧光信号的荧光强度变化约50%,灵敏度达到了约16.7%/ph,显示出优异的检测性能。在对血清样品进行准确性研究发现,在酸性和弱碱性环境中所述方法与ph计检测结果基本一致,准确性较好。与传统方法相比本发明所述检测方法具有灵敏、准确和生物相容性好等优势。

2、为达到此发明目的,本发明采用以下技术方案:

3、第一方面,本发明提供一种基于ssdna-(6,5)-swcnt的ph近红外检测方法,所述方法包括:

4、(a)将ph荧光探针溶液分别与待测样品和ph标准溶液混合反应,反应后进行近红外荧光光谱检测;

5、所述ph荧光探针溶液中包括表面含有ssdna修饰的(6,5)-swcnt,记为ssdna-(6,5)-swcnt,所述荧光探针溶液中ssdna-(6,5)-swcnt的终浓度为0.3-0.8mm,例如可以是0.3mm、0.4mm、0.5mm、0.6mm、0.7mm或0.8mm等;所述ssdna为含c碱基的ssdna;

6、(b)以ph值为横坐标,以荧光强度的变化率为纵坐标,对ph标准溶液的检测数据进行拟合,得到拟合方程;基于拟合方程计算待测样品的ph;所述荧光强度的变化率为的计算公式为:荧光强度的变化率=(f-f7)/f7;

7、其中,f为实验组的最大荧光强度,f7为将ph荧光探针溶液调节至ph=7.00后,所得溶液的最大荧光强度。

8、本发明利用单链dna(ssdna)和swcnts,设计了一种ssdna功能化的(6,5)-swcnt近红外荧光探针。该方法利用swcnts表面ssdna中胞嘧啶(c)碱基的质子化和去质子化过程,调控ssdna在swcnts表面的包裹紧密程度,从而影响swcnts的近红外荧光强度,实现不同ph值下快速准确的检测。与传统方法相比,这种核酸功能化的荧光探针具有灵敏、准确和生物相容性好等优势。

9、本发明考察了不同种类ssdna序列对ph的响应的影响,结果显示,不同ssdna替换的swcnts对ph的荧光响应存在显著差异。t碱基以及由at组成的(at)15和d序列(见实施例中表3)在不同ph值下的荧光强度变化较小,表明这些ssdna在swcnts表面的螺旋缠绕紧密度变化不大。而c碱基对不同ph的响应变化幅度较大,表明含c碱基的ssdna序列在swcnts表面缠绕紧密度会随着ph的变化而改变,从而引起荧光强度的变化。

10、优选地,步骤(a)中,所述ssdna的碱基的个数为15-30,例如可以是15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30。

11、优选地,步骤(a)中,所述c碱基的个数为3-21,例如可以是3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20或21。

12、本发明考察了c碱基的个数对ph检测的影响,结果表明,少量c碱基不利于质子化效应,导致ssdna在swcnts表面的螺旋结构变化较小,荧光变化率相对稳定。随着c碱基数量的增加,swcnts对不同ph的荧光响应显著增强。当c碱基数量增加至c15和c21时,虽然在ph=8.50时荧光响应有所增强,但在ph=6.00时荧光响应略有减弱;这可能是由于c碱基数量增加导致ssdna与swcnts的结合力减弱,部分削弱了质子化效应,使得荧光变化率在一定程度上减弱。鉴于c12在酸性和碱性条件下均展现出明显的荧光响应,并且整体荧光变化率最高,表明其在ph传感应用中具有最佳的性能,为了提高ph检测的灵敏度,选择了含有0-21个c碱基的ssdna序列进行后续研究。

13、优选地,步骤(a)中,所述c碱基以ccc组合分布,且在ssdna呈分散分布。

14、本发明考察了c碱基的位置对ph检测的影响,结果表明,c碱基的不同分布会导致荧光响应的差异,且大部分ssdna序列在酸性和碱性都有明显的响应。通过对比实验,结果发现c碱基以ccc组合分布的越分散,荧光信号的变化率越大。这可能是因为分散的ccc结构更容易发生质子化效应,使得ssdna在swcnts表面缠绕紧密程度的增加,从而引起更大的荧光信号改变。相反,h6是由12个c碱基的堆积分布,在酸性和碱性条件下荧光信号均降低,这不利于ph的检测。而h7(ccatccatccatccatccacc)在酸性和碱性条件下都表现出相对较弱的荧光响应,可能是因为ssdna结构都是cc的分布,即使cc碱基的分散程度较好,这种结构也不利于与h+的质子化效应,导致对不同ph的响应较弱。

15、优选地,步骤(a)中,所述ssdna-(6,5)-swcnt采用包括如下步骤的方法制备得到:

16、将(6,5)-swcnt溶液与ssdna溶液混合反应,得到混合液,再与甲醇混合直到出现浑浊,再采用异丙醇去除体系中的表面活性剂和多余的ssdna,离心收集沉淀得到ssdna-(6,5)-swcnt。

17、本发明中,采用双水相方法分离获得纯的(6,5)-swcnt上还包括分离(6,5)的过程中所用的表面活性剂有胆酸钠(sc)、脱氧胆酸钠(sdc)、十二烷基硫酸钠(sds)等。

18、优选地,所述探针溶液中(6,5)-swcnt溶液的浓度为0.1-1.5mg/ml,优选为0.3-0.8mg/ml,其中,0.1-1.5mg/ml例如可以是0.1mg/ml、0.2mg/ml、0.4mg/ml、0.5mg/ml、0.6mg/ml、0.8mg/ml、1.0mg/ml、1.2mg/ml、1.4mg/ml或1.5mg/ml等。

19、本发明中,对分离纯化得到的(6,5)-swcnt进行稀释,并将其在980nm处吸收峰强度控制在2.1左右,待用。

20、优选地,所述ssdna溶液的浓度为0.107-2.941mg/ml,优选为0.204-1.429mg/ml;其中,0.107-2.941mg/ml例如可以是0.107mg/ml、0.5mg/ml、1.0mg/ml、1.5mg/ml、2.0mg/ml、2.5mg/ml或2.941mg/ml等。

21、优选地,所述(6,5)-swcnt溶液与ssdna溶液混合的体积比为120:(1.3-50),优选为120:(2.5-20);其中,120:(1.3-50),例如可以是120:1.3、120:2.5、120:5、120:10、120:15、120:20、120:25、120:30、120:35、120:40、120:45或120:50等。

22、优选地,所述甲醇与混合液的体积比为(1-5):(1-5),例如可以是1:1、1:2、1:3、1:4、1:5、5:1、5:2、5:3或5:4等。

23、优选地,步骤(a)中,所述混合反应的体系中ssdna-(6,5)-swcnt的终浓度为0.03-0.08mm,例如可以是0.03mm、0.04mm、0.05mm、0.06mm、0.07mm或0.08mm等。

24、优选地,步骤(a)中,所述ph标准溶液的ph值在6.00-9.00范围内,例如可以是6.00、7.00、8.00或9.00等。

25、优选地,步骤(a)中,所述ph标准溶液包括:pb缓冲溶液。

26、优选地,步骤(a)中,所述混合反应的时间为15-90min,例如可以是15min、30min、45min、60min、75min或90min等。

27、优选地,步骤(a)中,所述混合反应的温度为20-24℃,例如可以是20℃、21℃、22℃、23℃或24℃等。

28、优选地,步骤(b)中,使用boltzmann方程进行拟合。

29、作为本发明的优选实施方式,所述基于ssdna-(6,5)-swcnt的ph近红外检测方法包括:

30、(a)将ph荧光探针溶液分别与待测样品和ph标准溶液混合反应,所述混合反应的时间为15-90min,所述混合反应的温度为20-24℃;所述混合反应的体系中ssdna-(6,5)-swcnt(ph荧光探针)的终浓度为0.03-0.08mm;反应后进行近红外荧光光谱检测。

31、所述ph荧光探针溶液中包括表面含有ssdna修饰的(6,5)-swcnt,记为ssdna-(6,5)-swcnt,所述荧光探针溶液中ssdna-(6,5)-swcnt的终浓度为0.3-0.8mm;所述ssdna为含c碱基的ssdna。

32、所述ph标准溶液的ph值在6.00-9.00范围内,所述ph标准溶液包括:pb缓冲溶液。

33、所述ssdna-(6,5)-swcnt采用包括如下步骤的方法制备得到:将(6,5)-swcnt溶液与ssdna溶液混合反应,其中,(6,5)-swcnt溶液的浓度为0.1-1.5mg/ml,ssdna溶液的浓度为0.107-2.941mg/ml,所述(6,5)-swcnt溶液与ssdna溶液混合的体积比为(120:1.3)-(120:50);混合反应后得到混合液;再将混合液与甲醇按体积比为(1-5):(1-5)混合直到出现浑浊,再采用异丙醇去除体系中的表面活性剂和多余的ssdna,离心收集沉淀得到ssdna-(6,5)-swcnt。

34、(b)以ph值为横坐标,以荧光强度的变化率为纵坐标,对ph标准溶液的检测数据进行拟合,使用boltzmann方程进行拟合得到拟合方程;基于拟合方程计算待测样品的ph;所述荧光强度的变化率为的计算公式为:荧光强度的变化率=(f-f7)/f7;

35、其中,f为实验组的最大荧光强度,f7为将ph荧光探针溶液调节至ph=7.00后,所得溶液的最大荧光强度。

36、第二方面,本发明提供一种基于ssdna-(6,5)-swcnt的ph近红外荧光探针,所述荧光探针为第一方面所述ssdna-(6,5)-swcnt。

37、第三方面,本发明提供一种基于ssdna-(6,5)-swcnt的ph近红外检测试剂盒,所述试剂盒包括第二方面所述的基于ssdna-(6,5)-swcnt的ph近红外荧光探针。

38、优选地,所述试剂盒还包括用于计算标准曲线的ph标准溶液。

39、优选地,所述ph标准溶液的ph值在6.00-9.00范围内,例如可以是6.00、7.00、8.00或9.00等。

40、优选地,所述ph标准溶液包括:pb缓冲溶液。

41、第四方面,本发明提供一种基于ssdna-(6,5)-swcnt的ph近红外荧光探针传感器,所述传感器包括与检测样品发生反应的荧光探针溶液;

42、所述荧光探针溶液包括表面含有ssdna修饰的(6,5)-swcnt,记为ssdna-(6,5)-swcnt;所述荧光探针溶液中ssdna-(6,5)-swcnt的终浓度为0.3-0.8mm;所述ssdna为含c碱基的ssdna。

43、优选地,所述ssdna的碱基的个数为15-30,例如可以是15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30。

44、优选地,所述c碱基的个数为3-21,例如可以是3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20或21。

45、优选地,所述c碱基以ccc组合分布,且在ssdna呈分散分布。

46、优选地,所述传感器还包括ph标准溶液。

47、优选地,所述所述ph标准溶液的ph值在6.00-9.00范围内,例如可以是6.00、7.00、8.00或9.00等。

48、优选地,所述ph标准溶液包括:pb缓冲溶液。

49、优选地,所述传感器还包括近红外荧光光谱检测仪器。

50、优选地,所述ssdna-(6,5)-swcnt采用包括如下步骤的方法制备得到:

51、将(6,5)-swcnt溶液与ssdna溶液混合反应,得到混合液,再与甲醇混合直到出现浑浊,再采用异丙醇去除体系中的表面活性剂和多余的ssdna,离心收集沉淀得到ssdna-(6,5)-swcnt。

52、优选地,所述探针溶液中(6,5)-swcnt溶液的浓度为0.1-1.5mg/ml,优选为0.3-0.8mg/ml;其中,0.1-1.5mg/ml例如可以是0.1mg/ml、0.2mg/ml、0.4mg/ml、0.5mg/ml、0.6mg/ml、0.8mg/ml、1.0mg/ml、1.2mg/ml、1.4mg/ml或1.5mg/ml等。

53、优选地,所述ssdna溶液的浓度为0.107-2.941mg/ml,优选为0.204-1.429mg/ml;其中,0.107-2.941mg/ml例如可以是0.107mg/ml、0.5mg/ml、1.0mg/ml、1.5mg/ml、2.0mg/ml、2.5mg/ml或2.941mg/ml等。

54、优选地,所述(6,5)-swcnt溶液与ssdna溶液混合的体积比为120:(1.3-50),优选为120:(2.5-20);其中,120:(1.3-50),例如可以是120:1.3、120:2.5、120:5、120:10、120:15、120:20、120:25、120:30、120:35、120:40、120:45或120:50等。

55、优选地,步骤s2中,所述甲醇与混合液的体积比为(1-5):(1-5),例如可以是1:1、1:2、1:3、1:4、1:5、5:1、5:2、5:3或5:4等。

56、优选地,所述传感器的使用方法包括:

57、(i)将ph荧光探针溶液分别与待测样品和ph标准溶液混合反应,反应后进行近红外荧光光谱检测;

58、(ii)以ph值为横坐标,以荧光强度的变化率为纵坐标,对ph标准溶液的检测数据进行拟合,得到拟合方程;基于拟合方程计算待测样品的ph;所述荧光强度的变化率为的计算公式为:荧光强度的变化率=(f-f7)/f7;

59、其中,f为实验组的最大荧光强度,f7为将ph荧光探针溶液调节至ph=7.00后,所得溶液的最大荧光强度。

60、优选地,步骤(i)中,所述混合反应的体系中ssdna-(6,5)-swcnt的终浓度为0.03-0.08mm,例如可以是0.03mm、0.04mm、0.05mm、0.06mm、0.07mm或0.08mm等。

61、优选地,步骤(i)中,所述ph标准溶液的ph值在6.00-9.00范围内,例如可以是6.00、7.00、8.00或9.00等。

62、优选地,步骤(i)中,所述ph标准溶液包括:pb缓冲溶液。

63、优选地,步骤(i)中,所述混合反应的时间为15-90min,例如可以是15min、30min、45min、60min、75min或90min等。

64、优选地,步骤(i)中,所述混合反应的温度为20-24℃,例如可以是20℃、21℃、22℃、23℃或24℃等。

65、优选地,步骤(ii)中,使用boltzmann方程进行拟合。

66、第五方面,本发明提供第一方面所述的基于ssdna-(6,5)-swcnt的ph检测方法、第二方面所述的基于ssdna-(6,5)-swcnt的ph近红外荧光探针、第三方面所述的基于ssdna-(6,5)-swcnt的ph近红外检测试剂盒或第四方面所述的基于ssdna-(6,5)-swcnt的ph近红外荧光探针传感器中任意一种或至少两种的组合在ph检测中的应用。

67、本发明所述的数值范围不仅包括上述列举的点值,还包括没有列举出的上述数值范围之间的任意的点值,限于篇幅及出于简明的考虑,本发明不再穷尽列举所述范围包括的具体点值。

68、相对于现有技术,本发明具有以下有益效果:

69、本发明基于swcnts表面含c碱基的ssdna在溶液中的质子化效应,可能导致ssdna与swcnts之间螺旋包裹的紧密程度的变化,从而引起swcnts荧光强度的改变,本发明设计的ssdna-(6,5)-swcnt ph荧光探针在ph 6.11-8.90范围内,荧光强度对ph的变化非常敏感,呈良好的相关性。在这个范围内,荧光强度变化约50%,灵敏度约16.7%/ph。在对血清样品进行准确性研究发现,在酸性和弱碱性环境中该荧光探针与ph计检测结果基本一致,准确性较好。


技术特征:

1.一种基于ssdna-(6,5)-swcnt的ph近红外检测方法,其特征在于,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的基于ssdna-(6,5)-swcnt的ph近红外检测方法,其特征在于,步骤(a)中,所述ssdna的碱基的个数为15-30;

3.根据权利要求1或2所述的基于ssdna-(6,5)-swcnt的ph近红外检测方法,其特征在于,步骤(a)中,所述ssdna-(6,5)-swcnt采用包括如下步骤的方法制备得到:

4.根据权利要求1-3中任一项所述的基于ssdna-(6,5)-swcnt的ph近红外检测方法,其特征在于,步骤(a)中,所述混合反应的体系中ssdna-(6,5)-swcnt的终浓度为0.03-0.08mm;

5.一种基于ssdna-(6,5)-swcnt的ph近红外荧光探针,其特征在于,所述荧光探针为权利要求1-4中任一项所述ssdna-(6,5)-swcnt。

6.一种基于ssdna-(6,5)-swcnt的ph近红外检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求5所述的基于ssdna-(6,5)-swcnt的ph近红外荧光探针;

7.一种基于ssdna-(6,5)-swcnt的ph近红外荧光探针传感器,其特征在于,所述传感器包括与检测样品发生反应的荧光探针溶液;

8.根据权利要求7所述的基于ssdna-(6,5)-swcnt的ph近红外荧光探针传感器,其特征在于,所述ssdna的碱基的个数为15-30;

9.根据权利要求7或8所述的基于ssdna-(6,5)-swcnt的ph近红外荧光探针传感器,其特征在于,所述ssdna-(6,5)-swcnt采用包括如下步骤的方法制备得到:

10.权利要求1-4中任一项所述的基于ssdna-(6,5)-swcnt的ph检测方法、权利要求5所述的基于ssdna-(6,5)-swcnt的ph近红外荧光探针、权利要求6所述的基于ssdna-(6,5)-swcnt的ph近红外检测试剂盒或权利要求7-9中任一项所述的基于ssdna-(6,5)-swcnt的ph近红外荧光探针传感器中任意一种或至少两种的组合在ph检测中的应用。


技术总结
本发明提供了一种基于ssDNA‑(6,5)‑SWCNT的pH近红外检测方法及其应用,本发明利用单链DNA和SWCNTs,设计了一种ssDNA功能化的(6,5)‑SWCNT近红外荧光探针。所述方法利用SWCNTs表面ssDNA中胞嘧啶C碱基的质子化和去质子化过程,调控ssDNA在SWCNTs表面的包裹紧密程度,从而影响SWCNTs的近红外荧光强度,实现不同pH值下快速准确的检测。与传统方法相比,这种核酸功能化的荧光探针具有灵敏、准确和生物相容性好等优势。

技术研发人员:刘刚,李兰英,王乐乐,曹晓迪,闻艳丽,曹梅霞,陶晴
受保护的技术使用者:上海市计量测试技术研究院(中国上海测试中心、华东国家计量测试中心、上海市计量器具强制检定中心)
技术研发日:
技术公布日:2024/11/11
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