一种评估雷州黑鸭开产蛋重的方法

专利2025-03-31  10


本发明涉及雷州黑鸭分子标记,更具体地,涉及一种评估雷州黑鸭开产蛋重的方法。


背景技术:

1、雷州黑鸭是由雷州半岛的农民长期放养的地方鸭种群,广泛分布于广东省湛江市雷州。该品种具有个体较小、产蛋量丰富、蛋型较大、肉质鲜美,并表现出耐粗饲、抗病力强、觅食能力强和环境适应性广泛等特点。然而,由于缺乏系统选育导致个体间存在较大差异,雷州黑鸭难以形成规模化生产;同时,在种鸭生产技术方面,商业蛋鸭与雷州黑鸭公鸭随意交配后被作为种鸭使用。这严重制约了雷州黑鸭的挖掘和发展。

2、另外,雷州黑鸭在我国地方黑羽鸭品种资源稀缺的背景下具有较高的物种价值。受当地饮食文化影响,雷州黑鸭对于鸭蛋及其制品的需求量大,因此具备良好的市场前景。为了进一步推动该品种系统选育研究,提高雷州黑鸭产蛋量显得尤为重要。加强对其选育工作的重视和投入,通过科学合理地选择父母代进行配对,以先进的繁殖技术来提高品质稳定性和遗传纯度,在保留原有特点基础上提升雷州黑鸭品质水平,并建立起规范化、标准化的生产体系,才能更好地满足市场需求并促进当地经济发展。

3、镁依赖型蛋白磷酸酶1d(phosphatase 1d magnesium-dependent,deltaisoform,ppm1d)是蛋白磷酸酶pp2c家族的成员,别名jdvs、wip1、iddgip、pp2c-delta。pp2c家族成员是细胞应激反应途径的负调控因子,该基因的表达在不同的环境胁迫下以p53依赖的方式诱导。在肿瘤抑制蛋白tp53/p53诱导下,这种磷酸酶负性调节p38-map激酶mapk/p38的活性,从而降低p53的磷酸化,进而抑制p53介导的转录和凋亡。因此,这种磷酸酶介导p38-p53信号的反馈调节,有助于生长抑制和抑制应激诱导的凋亡。多种实体如神经母细胞癌、随母细胞癌、卵巢癌能够检测到ppm1d表达的升高,可能是一种癌变细胞。

4、现有技术并没有报道其与禽类的产蛋相关。


技术实现思路

1、本发明的目的是为了克服现有技术的不足,提供一种评估雷州黑鸭开产蛋重的方法。

2、本发明的第一个目的是提供检测雷州黑鸭snp分子标记的基因型的产品在建立评估雷州黑鸭开产蛋重的方法中的应用。

3、本发明的第二个目的是提供一种评估雷州黑鸭开产蛋重的方法。

4、本发明的第三个目的是提供一种检测雷州黑鸭snp分子标记的基因型的试剂在制备评估雷州黑鸭开产蛋重的试剂盒中的应用。

5、本发明的第四个目的是提供一种评估雷州黑鸭开产蛋重的试剂盒。

6、本发明的第五个目的是提供所述的产品、所述方法或任一所述试剂盒在雷州黑鸭开产蛋重的分子育种中的应用。

7、本发明的第六个目的是提供所述的产品、所述方法或任一所述试剂盒在雷州黑鸭杂交后代鉴定中的应用。

8、为了实现上述目的,本发明是通过以下技术方案予以实现的:

9、本发明要求保护检测雷州黑鸭snp分子标记的基因型的产品在建立评估雷州黑鸭开产蛋重的方法中的应用,所述snp分子标记位于nc_051791.1:2556550,即zju1.0版鸭基因组的第20染色体的第2556550位核苷酸,所述snp位点的基因型为cc基因型个体或ct基因型个体的开产蛋重显著高于tt基因型个体的开产蛋重。

10、以及,一种评估雷州黑鸭开产蛋重的方法,检测标记位于nc_051791.1:2556550,即zju1.0版鸭基因组的第20染色体的第2556550位核苷酸的snp分子标记的基因型,cc基因型个体或ct基因型个体的开产蛋重显著高于tt基因型个体的开产蛋重。

11、优选地,使用核苷酸序列如seq id no:1~2所示引物进行pcr扩增后对产物进行测序。

12、作为一个具体的实施方式:

13、使用核苷酸序列如seq id no:1~2所示的引物对雷州黑鸭基因组dna进行pcr扩增,

14、pcr反应体系共25μl:dna模板1.0μl,上下游引物各0.7μl,2×green taq mix12.5μl,ddh2o 10.1μl。

15、pcr扩增过程:95℃预变性5min;94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延展1min,共34个循环;72℃延展10min。

16、将pcr产物经1%琼脂糖凝胶电泳检测后,生工生物工程有限公司进行测序。

17、本发明还要求保护一种检测雷州黑鸭snp分子标记的基因型的试剂在制备评估雷州黑鸭开产蛋重的试剂盒中的应用,所述snp分子标记位于nc_051791.1:2556550,即zju1.0版鸭基因组的第20染色体的第2556550位核苷酸,所述snp位点的基因型为cc基因型个体或ct基因型个体的开产蛋重显著高于tt基因型个体的开产蛋重。

18、优选地,所述试剂为核苷酸序列如seq id no:1~2所示引物。

19、以及,一种评估雷州黑鸭开产蛋重的试剂盒,含有所述的试剂。

20、优选地,所述试剂为核苷酸序列如seq id no:1~2所示引物。

21、更优选地,还含有pcr扩增试剂。

22、作为一个具体的实施方式,所述试剂盒含有2×green taq mix,核苷酸序列如seqid no:1~2所示的引物和ddh2o;

23、其使用方法为:

24、使用核苷酸序列如seq id no:1~2所示的引物对雷州黑鸭基因组dna进行pcr扩增,

25、pcr反应体系共25μl:dna模板1.0μl,上下游引物各0.7μl,2×green taq mix12.5μl,ddh2o 10.1μl。

26、pcr扩增过程:95℃预变性5min;94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延展1min,共34个循环;72℃延展10min。

27、将pcr产物经1%琼脂糖凝胶电泳检测后,生工生物工程有限公司进行测序。

28、本发明还要求保护以下应用:

29、所述的产品、所述方法或任一所述试剂盒在雷州黑鸭开产蛋重的分子育种中的应用。

30、所述的产品、所述方法或任一所述试剂盒在雷州黑鸭杂交后代鉴定中的应用。

31、与现有技术相比,本发明具有如下有益效果:

32、本发明发现ppmid的i4-8248 c>t的基因位点与雷州黑鸭开产蛋重显著相关,cc基因型个体或ct基因型个体的开产蛋重显著高于tt基因型个体的开产蛋重,其可以作为筛选优质高产雷州黑鸭的重要分子标记。



技术特征:

1.检测雷州黑鸭snp分子标记的基因型的产品在建立评估雷州黑鸭开产蛋重的方法中的应用,其特征在于,所述snp分子标记位于nc_051791.1:2556550,即zju1.0版鸭基因组的第20染色体的第2556550位核苷酸,所述snp位点的基因型为cc基因型个体或ct基因型个体的开产蛋重显著高于tt基因型个体的开产蛋重。

2.一种评估雷州黑鸭开产蛋重的方法,其特征在于,检测标记位于nc_051791.1:2556550,即zju1.0版鸭基因组的第20染色体的第2556550位核苷酸的snp分子标记的基因型,cc基因型个体或ct基因型个体的开产蛋重显著高于tt基因型个体的开产蛋重。

3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,使用核苷酸序列如seq id no:1~2所示引物进行pcr扩增后对产物进行测序。

4.一种检测雷州黑鸭snp分子标记的基因型的试剂在制备评估雷州黑鸭开产蛋重的试剂盒中的应用,其特征在于,所述snp分子标记位于nc_051791.1:2556550,即zju1.0版鸭基因组的第20染色体的第2556550位核苷酸,所述snp位点的基因型为cc基因型个体或ct基因型个体的开产蛋重显著高于tt基因型个体的开产蛋重。

5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述试剂为核苷酸序列如seq id no:1~2所示引物。

6.一种评估雷州黑鸭开产蛋重的试剂盒,其特征在于,含有权利要求1中所述的试剂。

7.根据权利要求6所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂为核苷酸序列如seq id no:1~2所示引物。

8.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,还含有pcr扩增试剂。

9.权利要求1中所述的产品、权利要求2或3所述方法或权利要求要求6到8任一所述试剂盒在雷州黑鸭开产蛋重的分子育种中的应用。

10.权利要求1中所述的产品、权利要求2或3所述方法或权利要求要求6到8任一所述试剂盒在雷州黑鸭杂交后代鉴定中的应用。


技术总结
本发明公开了一种评估雷州黑鸭开产蛋重的方法,本发明发现PPMID的I4‑8248C>T的基因位点与雷州黑鸭开产蛋重显著相关,其位于NC_051791.1:2556550,即ZJU1.0版鸭基因组的第20染色体的第2556550位核苷酸,所述SNP位点的基因型为CC基因型个体或CT基因型个体的开产蛋重显著高于TT基因型个体的开产蛋重,其可以作为筛选优质高产雷州黑鸭的重要分子标记。

技术研发人员:姜平,赵志辉,苏瑛,李靖,苗丰帅,张颖健
受保护的技术使用者:广东海洋大学
技术研发日:
技术公布日:2024/11/11
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