本发明涉及结合鲍氏不动杆菌(acinetobacter baumannii)的抗体,以及它们在诊断、预防和治疗由鲍氏不动杆菌引起的细菌感染中的用途。
背景技术:
1、不动杆菌属由26种已命名的物种和9种基因组物种组成。鲍氏不动杆菌是一种主要与医院获得性感染相关的细菌病原体。它是一种革兰氏阴性杆菌。
2、鲍氏不动杆菌特异性地靶向湿组织,诸如粘膜或暴露的皮肤区域。如果不治疗,这种感染会导致败血症和死亡。一旦鲍氏不动杆菌处于医院环境中,就会带来重大风险,特别是在患者患有慢性病的icu病房中。
3、碳青霉烯是β-内酰胺类抗生素,它们在结构上不同于其他常用的β-内酰胺类抗生素,诸如青霉素和头孢菌素类。碳青霉烯已被证明是治疗产超广谱β-内酰胺酶(esbl)细菌(包括鲍氏不动杆菌菌株)的药物选择,这些细菌与医院环境中的严重感染(诸如肺炎和菌血症)的不良临床结果相关。
4、世界卫生组织将耐碳青霉烯鲍氏不动杆菌(crab)列为对人类健康最具威胁的病原体之一。实际上,crab是许多发展中国家和发达国家中呼吸机相关性肺炎(vap)的重要原因,并且发展中国家的一些研究发现,crab是30%以上的新生儿败血症病例的原因。
5、目前,鲍氏不动杆菌分类包括3个欧洲克隆(eci-iii)、8个世界范围的克隆(ww1-8-现已实际成为8个国际克隆,ic1-8)和2个全球克隆(gc1和2)。eci=ww1=ic1、ecii=ww2=ic2和eciii=ww3=ic3,并且全部都由多基因座序列分型(mlst)定义,而分别等于ic1和2的全球克隆1和2也由全基因组系统发生学(pathog dis.[病原体和疾病]2014年8月;71(3):292-301.doi:10.1111/2049-632x.12125.2014年1月27日电子出版,其内容通过援引并入本文)支持。
6、研究表明,gc2是与碳青霉烯抗性相关的主要全球谱系。
7、本发明旨在提供用于诊断和治疗由鲍氏不动杆菌引起的细菌感染的单克隆抗体。
技术实现思路
1、本发明提供了适用于诊断、预防和治疗由鲍氏不动杆菌引起的细菌感染的单克隆抗体。特别地,本发明提供了特异性结合在鲍氏不动杆菌细菌的细菌壁处的单克隆抗体,诸如在例如活细菌上。有利地,本发明提供了特异性结合在鲍氏不动杆菌细菌的细菌壁处并诱导补体激活(例如如通过基于流式细胞术的测定法所测量的)的单克隆抗体。
2、本发明确定了在鲍氏不动杆菌细菌的表面处的新型抗体靶标,用于诊断、预防和治疗由鲍氏不动杆菌引起的细菌感染。特别地,本发明首次证明了oxa-23酶存在于活细菌的表面处并且可以被诊断和治疗抗体靶向。此外,本发明首次证明了脂寡糖(los)型oc1位于活细菌的表面处并且可以被诊断和治疗抗体靶向。最后,本发明首次证明了位于活细菌的表面处的kl49碳水化合物荚膜抗原可以被诊断和治疗抗体靶向。对这些在鲍氏不动杆菌细菌的表面处的新靶标的验证在诊断、预防和治疗由鲍氏不动杆菌引起的细菌感染中提供了重要的进展。虽然不限于此,但本发明针对由耐碳青霉烯鲍氏不动杆菌(crab)引起的细菌感染的诊断、预防和治疗提供了特别重要的进步,在这些细菌中现有的碳青霉烯治疗将是无效的。如上所述,crab与鲍氏不动杆菌的g2谱系特别相关。
3、本发明进一步提供了结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oxa-23的新型单克隆抗体。此类抗体在鲍氏不动杆菌的诊断中特别有用。本发明进一步提供了新型抗体,这些新型抗体结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oxa-23并诱导补体激活,从而杀死细菌。此类抗体在预防和治疗由鲍氏不动杆菌引起的细菌感染方面特别有用。
4、本发明进一步提供了结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oc1 los的新型单克隆抗体。此类抗体在鲍氏不动杆菌的诊断中特别有用。本发明进一步提供了新型抗体,这些新型抗体结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oc1 los并诱导补体激活,从而杀死细菌。此类抗体在预防和治疗由鲍氏不动杆菌引起的细菌感染方面特别有用。
5、本发明进一步提供了结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49的新型单克隆抗体。此类抗体在鲍氏不动杆菌的诊断中特别有用。本发明进一步提供了新型抗体,这些新型抗体结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49并诱导补体激活,从而杀死细菌。此类抗体在预防和治疗由鲍氏不动杆菌引起的细菌感染方面特别有用。
6、抗体序列在本文中通过参考相关抗体的内部参考号以及seq id no来提及。本文中引用抗体参考编号的任何披露内容旨在包括具有如表1和表2中呈现的相应核酸或氨基酸序列号(seq id no)的披露内容。
7、3.1抗oxa-23抗体
8、本文提供了特异性结合oxa-23的抗体。例如,已发现本文例示的抗体1348、1349、1540、1548和1550特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的外膜囊泡(omv)上的oxa-23。
9、本发明提供了一种特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oxa-23的抗体,诸如在例如活细菌上。在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oxa-23,如通过间接全细菌细胞elisa所测量的。由于鲍氏不动杆菌细菌的外膜囊泡(omv)与活鲍氏不动杆菌细菌之间具有高度相关性,因此已发现此类抗体也特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的外膜囊泡(omv)上的oxa-23。
10、在一个实施例中,该抗体诱导补体激活(例如,如通过基于流式细胞术的测定法所测量的)。
11、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oxa-23并诱导补体激活(例如,如通过基于流式细胞术的测定法所测量的),并且hcdr3是抗体1348、1349、1540、1548或1550的hcdr3。
12、在一个实施例中,该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列包含互补决定区(cdr)hcdr1、hcdr2和hcdr3,该可变轻链(vl)结构域序列包含互补决定区lcdr1、lcdr2和lcdr3,
13、其中hcdr3是抗体1348、1349、1540、1548或1550的hcdr3。
14、在一个实施例中,hcdr3是抗体1348的hcdr3。
15、在一个实施例中,hcdr3是抗体1349的hcdr3。
16、在一个实施例中,hcdr3是抗体1540的hcdr3。
17、在一个实施例中,hcdr3是抗体1548的hcdr3。
18、在一个实施例中,hcdr3是抗体1550的hcdr3。
19、在一个实施例中,本发明提供了抗oxa-23抗体,
20、其中该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oxa-23并诱导补体激活(例如,如通过基于流式细胞术的测定法所测量的),并且
21、其中该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列包含互补决定区(cdr)hcdr1、hcdr2和hcdr3,该可变轻链(vl)结构域序列包含互补决定区lcdr1、lcdr2和lcdr3,
22、其中这6个cdr是抗体1348、1349、1540、1548或1550的cdr。
23、在一个实施例中,本发明提供了抗oxa-23抗体,
24、其中该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列包含互补决定区(cdr)hcdr1、hcdr2和hcdr3,该可变轻链(vl)结构域序列包含互补决定区lcdr1、lcdr2和lcdr3,
25、其中这6个cdr是抗体1348、1349、1540、1548或1550的cdr。
26、在一个实施例中,该抗体具有抗体1348的6个cdr。
27、在一个实施例中,该抗体具有抗体1349的6个cdr。
28、在一个实施例中,该抗体具有抗体1540的6个cdr。
29、在一个实施例中,该抗体具有抗体1548的6个cdr。
30、在一个实施例中,该抗体具有抗体1550的6个cdr。
31、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oxa-23并诱导补体激活(例如,如通过基于流式细胞术的测定法所测量的),并且
32、可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列分别包含抗体1348、1349、1540、1548或1550的可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,任选地在可变重链(vh)结构域序列中的互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,并且任选地在可变轻链(vl)结构域序列中的互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
33、在一个实施例中,该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,并且其中可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列分别包含抗体1348、1349、1540、1548或1550的可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,任选地在可变重链(vh)结构域序列中的互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,并且任选地在可变轻链(vl)结构域序列中的互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
34、在一个实施例中,该抗体包含抗体1348的可变重链(vh)结构域序列和抗体1348的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
35、在一个实施例中,该抗体包含抗体1349的可变重链(vh)结构域序列和抗体1349的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
36、在一个实施例中,该抗体包含抗体1540的可变重链(vh)结构域序列和抗体1540的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
37、在一个实施例中,该抗体包含抗体1548的可变重链(vh)结构域序列和抗体1548的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
38、在一个实施例中,该抗体包含抗体1550的可变重链(vh)结构域序列和抗体1550的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
39、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oxa-23并诱导补体激活(例如,如通过基于流式细胞术的测定法所测量的),并且
40、该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,并且其中可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列分别包含与抗体1348、1349、1540、1548或1550的可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,
41、条件是该抗体分别具有抗体1348、1349、1540、1548或1550的cdr。
42、在一个实施例中,该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,并且其中可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列分别包含与抗体1348、1349、1540、1548或1550的可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,
43、条件是该抗体分别具有抗体1348、1349、1540、1548或1550的cdr。
44、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1348的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1348的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1348的cdr。
45、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1349的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1349的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1349的cdr。
46、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1540的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1540的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1540的cdr。
47、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1548的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1548的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1548的cdr。
48、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1550的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1550的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1550的cdr。
49、在一个实施例中,本发明提供了一种特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oxa-23的抗体,
50、其中该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,并且其中可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列分别包含抗体1348、1349、1540、1548或1550的可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列。
51、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oxa-23,其中该抗体包含抗体1348的vh和vl结构域序列。
52、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oxa-23,其中该抗体包含抗体1349的vh和vl结构域序列。
53、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oxa-23,其中该抗体包含抗体1540的vh和vl结构域序列。
54、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oxa-23,其中该抗体包含抗体1548的vh和vl结构域序列。
55、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oxa-23,其中该抗体包含抗体1550的vh和vl结构域序列。
56、在一个实施例中,该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,并且其中可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列分别包含抗体1348、1349、1540、1548或1550的可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列。
57、在一个实施例中,该抗体包含抗体1348的vh结构域序列和vl结构域序列。
58、在一个实施例中,该抗体包含抗体1349的vh结构域序列和vl结构域序列。
59、在一个实施例中,该抗体包含抗体1540的vh结构域序列和vl结构域序列。
60、在一个实施例中,该抗体包含抗体1548的vh结构域序列和vl结构域序列。
61、在一个实施例中,该抗体包含抗体1550的vh结构域序列和vl结构域序列。
62、在一个实例中,该抗体选自由抗体1348、1349、1540、1548或1550组成的组。
63、在一个实施例中,该抗体是抗体1348。
64、在一个实施例中,该抗体是抗体1349。
65、在一个实施例中,该抗体是抗体1540。
66、在一个实施例中,该抗体是抗体1548。
67、在一个实施例中,该抗体是抗体1550。
68、提供了与本文任何地方描述的抗体结合oxa-23上相同表位的抗体。
69、提供了与抗体1348、1349、1540、1548或1550(例如由其vh和vl序列定义)结合相同表位的抗体。
70、在一个实施例中,提供了与抗体1348(例如由其vh和vl序列定义)结合相同表位的抗体。
71、在一个实施例中,提供了与抗体1349(例如由其vh和vl序列定义)结合相同表位的抗体。
72、在一个实施例中,提供了与抗体1540(例如由其vh和vl序列定义)结合相同表位的抗体。
73、在一个实施例中,提供了与抗体1548(例如由其vh和vl序列定义)结合相同表位的抗体。
74、在一个实施例中,提供了与抗体1550(例如由其vh和vl序列定义)结合相同表位的抗体。
75、抗体可与具有与本文任何地方披露的抗体的足迹完全或部分重叠的足迹的oxa-23接触。如本文其他地方所述,可例如使用spr来确定抗体之间的竞争,并且提供与本文任何地方所述的igg抗体竞争结合oxa-23(竞争结合它们的表位)的抗体。
76、本发明的抗体可以是与本文所述的任何抗oxa-23抗体(诸如抗体1348、1349、1540、1548和1550,例如由它们各自的vh和vl序列定义)竞争结合oxa-23的抗体。
77、本发明的抗体可以是与抗体1348竞争结合oxa-23的抗体。
78、本发明的抗体可以是与抗体1349竞争结合oxa-23的抗体。
79、本发明的抗体可以是与抗体1540竞争结合oxa-23的抗体。
80、本发明的抗体可以是与抗体1548竞争结合oxa-23的抗体。
81、本发明的抗体可以是与抗体1550竞争结合oxa-23的抗体。
82、本发明提供的核酸序列可以包含编码如本文任何地方所定义的抗oxa-23抗体的vh结构域和/或vl结构域的序列。
83、该核酸可以包含编码抗体1348的vh结构域和/或vl结构域的序列。
84、该核酸可以包含编码抗体1349的vh结构域和/或vl结构域的序列。
85、该核酸可以包含编码抗体1540的vh结构域和/或vl结构域的序列。
86、该核酸可以包含编码抗体1548的vh结构域和/或vl结构域的序列。
87、该核酸可以包含编码抗体1550的vh结构域和/或vl结构域的序列。
88、3.2抗oc1 los抗体
89、本文提供了特异性结合oc1脂寡糖(los)的抗体。例如,已发现本文示例的抗体1042、1043、1403、1405、1407、1408和1413特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oc1los。
90、本发明提供了一种特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oc1 los的抗体,诸如在例如活细菌上。在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oc1los,如通过间接全细菌细胞elisa所测量的。由于鲍氏不动杆菌细菌的外膜囊泡(omv)与活鲍氏不动杆菌细菌之间具有高度相关性,因此已发现此类抗体也特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的外膜囊泡(omv)上的oc1 los。
91、在一个实施例中,该抗体诱导补体激活(例如,如通过基于流式细胞术的测定法所测量的)。
92、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oc1los并诱导补体激活(例如,如通过基于流式细胞术的测定法所测量的),并且hcdr3是抗体1042、1043、1403、1405、1407、1408或1413的hcdr3。
93、在一个实施例中,该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列包含互补决定区(cdr)hcdr1、hcdr2和hcdr3,该可变轻链(vl)结构域序列包含互补决定区lcdr1、lcdr2和lcdr3,
94、其中hcdr3是抗体1042、1043、1403、1405、1407、1408或1413的hcdr3。
95、在一个实施例中,hcdr3是抗体1042的hcdr3。
96、在一个实施例中,hcdr3是抗体1043的hcdr3。
97、在一个实施例中,hcdr3是抗体1403的hcdr3。
98、在一个实施例中,hcdr3是抗体1405的hcdr3。
99、在一个实施例中,hcdr3是抗体1407的hcdr3。
100、在一个实施例中,hcdr3是抗体1408的hcdr3。
101、在一个实施例中,hcdr3是抗体1413的hcdr3。
102、在一个实施例中,本发明提供了抗oc1 los抗体,
103、其中该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oc1 los并诱导补体激活(例如,如通过基于流式细胞术的测定法所测量的),并且
104、其中该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列包含互补决定区(cdr)hcdr1、hcdr2和hcdr3,该可变轻链(vl)结构域序列包含互补决定区lcdr1、lcdr2和lcdr3,
105、其中这6个cdr是抗体1042、1043、1403、1405、1407、1408或1413的cdr。
106、在一个实施例中,本发明提供了抗oc1 los抗体,
107、其中该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列包含互补决定区(cdr)hcdr1、hcdr2和hcdr3,该可变轻链(vl)结构域序列包含互补决定区lcdr1、lcdr2和lcdr3,
108、其中这6个cdr是抗体1042、1043、1403、1405、1407、1408或1413的cdr。
109、在一个实施例中,该抗体具有抗体1042的6个cdr。
110、在一个实施例中,该抗体具有抗体1043的6个cdr。
111、在一个实施例中,该抗体具有抗体1403的6个cdr。
112、在一个实施例中,该抗体具有抗体1405的6个cdr。
113、在一个实施例中,该抗体具有抗体1407的6个cdr。
114、在一个实施例中,该抗体具有抗体1408的6个cdr。
115、在一个实施例中,该抗体具有抗体1413的6个cdr。
116、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oc1los并诱导补体激活(例如,如通过基于流式细胞术的测定法所测量的),并且
117、可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列分别包含抗体1042、1043、1403、1405、1407、1408或1413的可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,任选地在可变重链(vh)结构域序列中的互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,并且任选地在可变轻链(vl)结构域序列中的互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
118、在一个实施例中,该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,并且其中可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列分别包含抗体1042、1043、1403、1405、1407、1408或1413的可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,任选地在可变重链(vh)结构域序列中的互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,并且任选地在可变轻链(vl)结构域序列中的互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
119、在一个实施例中,该抗体包含抗体1042的可变重链(vh)结构域序列和抗体1042的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
120、在一个实施例中,该抗体包含抗体1043的可变重链(vh)结构域序列和抗体1043的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
121、在一个实施例中,该抗体包含抗体1403的可变重链(vh)结构域序列和抗体1403的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
122、在一个实施例中,该抗体包含抗体1405的可变重链(vh)结构域序列和抗体1405的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
123、在一个实施例中,该抗体包含抗体1407的可变重链(vh)结构域序列和抗体1407的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
124、在一个实施例中,该抗体包含抗体1408的可变重链(vh)结构域序列和抗体1408的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
125、在一个实施例中,该抗体包含抗体1413的可变重链(vh)结构域序列和抗体1413的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
126、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌表面处的oc1 los并诱导补体激活(例如,如通过基于流式细胞术的测定法所测量的),并且
127、该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,并且其中可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列分别包含与抗体1042、1043、1403、1405、1407、1408或1413的可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,
128、条件是该抗体分别具有抗体1042、1043、1403、1405、1407、1408或1413的6个cdr。
129、在一个实施例中,该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,并且其中可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列分别包含与抗体1042、1043、1403、1405、1407、1408或1413的可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,
130、条件是该抗体分别具有抗体1042、1043、1403、1405、1407、1408或1413的6个cdr。
131、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1042的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1042的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1042的6个cdr。
132、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1043的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1043的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1043的6个cdr。
133、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1403的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1403的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1403的6个cdr。
134、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1405的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1405的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1405的6个cdr。
135、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1407的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1407的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1407的6个cdr。
136、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1408的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1408的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1408的6个cdr。
137、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1413的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1413的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1413的6个cdr。
138、在一个实施例中,本发明提供了一种特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oc1 los的抗体,
139、其中该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,并且其中可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列分别包含抗体1042、1043、1403、1405、1407、1408或1413的可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列。
140、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oc1los,其中该抗体包含抗体1042的vh和vl结构域序列。
141、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oc1los,其中该抗体包含抗体1043的vh和vl结构域序列。
142、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oc1los,其中该抗体包含抗体1403的vh和vl结构域序列。
143、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oc1los,其中该抗体包含抗体1405的vh和vl结构域序列。
144、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oc1los,其中该抗体包含抗体1407的vh和vl结构域序列。
145、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oc1los,其中该抗体包含抗体1408的vh和vl结构域序列。
146、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oc1los,其中该抗体包含抗体1413的vh和vl结构域序列。
147、在一个实施例中,该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,并且其中可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列分别包含抗体1042、1043、1403、1405、1407、1408或1413的可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列。
148、在一个实施例中,该抗体包含抗体1042的vh结构域序列和vl结构域序列。
149、在一个实施例中,该抗体包含抗体1043的vh结构域序列和vl结构域序列。
150、在一个实施例中,该抗体包含抗体1403的vh结构域序列和vl结构域序列。
151、在一个实施例中,该抗体包含抗体1405的vh结构域序列和vl结构域序列。
152、在一个实施例中,该抗体包含抗体1407的vh结构域序列和vl结构域序列。
153、在一个实施例中,该抗体包含抗体1408的vh结构域序列和vl结构域序列。
154、在一个实施例中,该抗体包含抗体1413的vh结构域序列和vl结构域序列。
155、在一个实例中,抗体选自由抗体1042、1043、1403、1405、1407、1408和1413组成的组。
156、在一个实施例中,该抗体是抗体1042。
157、在一个实施例中,该抗体是抗体1043。
158、在一个实施例中,该抗体是抗体1403。
159、在一个实施例中,该抗体是抗体1405。
160、在一个实施例中,该抗体是抗体1407。
161、在一个实施例中,该抗体是抗体1408。
162、在一个实施例中,该抗体是抗体1413。
163、提供了与本文任何地方描述的抗体结合oc1 los上相同表位的抗体。
164、提供了与抗体1042、1043、1403、1405、1407、1408或1413(例如由其vh和vl序列定义)结合相同表位的抗体。
165、在一个实施例中,提供了与抗体1042结合相同表位的抗体。
166、在一个实施例中,提供了与抗体1043结合相同表位的抗体。
167、在一个实施例中,提供了与抗体1403结合相同表位的抗体。
168、在一个实施例中,提供了与抗体1405结合相同表位的抗体。
169、在一个实施例中,提供了与抗体1407结合相同表位的抗体。
170、在一个实施例中,提供了与抗体1408结合相同表位的抗体。
171、在一个实施例中,提供了与抗体1413结合相同表位的抗体。
172、抗体可与具有与本文任何地方披露的抗体的足迹完全或部分重叠的足迹的oc1los接触。如本文其他地方所述,可例如使用spr来确定抗体之间的竞争,并且提供与本文任何地方所述的igg抗体竞争结合oc1 los(竞争结合它们的表位)的抗体。
173、本发明的抗体可以是与本文所述的任何抗oc1 los抗体(诸如抗体1042、1043、1403、1405、1407、1408和1413,例如由其vh和vl序列定义)竞争结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oc1 los的抗体。
174、本发明的抗体可以是与抗体1042竞争结合oc1 los的抗体。
175、本发明的抗体可以是与抗体1043竞争结合oc1 los的抗体。
176、本发明的抗体可以是与抗体1403竞争结合oc1 los的抗体。
177、本发明的抗体可以是与抗体1405竞争结合oc1 los的抗体。
178、本发明的抗体可以是与抗体1407竞争结合oc1 los的抗体。
179、本发明的抗体可以是与抗体1408竞争结合oc1 los的抗体。
180、本发明的抗体可以是与抗体1413竞争结合oc1 los的抗体。
181、本发明提供的核酸序列可以包含编码如本文任何地方所定义的抗oc1los抗体的vh结构域和/或vl结构域的序列。
182、该核酸可以包含编码抗体1042的vh结构域和/或vl结构域的序列。
183、该核酸可以包含编码抗体1043的vh结构域和/或vl结构域的序列。
184、该核酸可以包含编码抗体1403的vh结构域和/或vl结构域的序列。
185、该核酸可以包含编码抗体1405的vh结构域和/或vl结构域的序列。
186、该核酸可以包含编码抗体1407的vh结构域和/或vl结构域的序列。
187、该核酸可以包含编码抗体1408的vh结构域和/或vl结构域的序列。
188、该核酸可以包含编码抗体1413的vh结构域和/或vl结构域的序列。
189、3.3抗kl49抗体
190、本文提供了特异性结合kl49的抗体。例如,已发现本文示例的抗体1345、1347、1350、1351、1363、1364、1397、1398、1400、1401、1402、1404、1409、1410、1412、1414、1415和1416特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49。
191、本发明提供了一种特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49的抗体,诸如在例如活细菌上。在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49,如通过间接全细菌细胞elisa所测量的。由于鲍氏不动杆菌细菌的外膜囊泡(omv)与活鲍氏不动杆菌细菌之间具有高度相关性,因此已发现此类抗体也特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的外膜囊泡(omv)上的kl49。
192、在一个实施例中,该抗体诱导补体激活(例如,如通过基于流式细胞术的测定法所测量的)。
193、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌表面处的kl49并诱导补体激活(例如,如通过基于流式细胞术的测定法所测量的),并且hcdr3是抗体1345、1347、1350、1351、1363、1364、1397、1398、1400、1401、1402、1404、1409、1410、1412、1414、1415或1416的hcdr3。
194、在一个实施例中,该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列包含互补决定区(cdr)hcdr1、hcdr2和hcdr3,该可变轻链(vl)结构域序列包含互补决定区lcdr1、lcdr2和lcdr3,
195、其中该hcdr3是抗体1345、1347、1350、1351、1363、1364、1397、1398、1400、1401、1402、1404、1409、1410、1412、1414、1415或1416的hcdr3。
196、在一个实施例中,hcdr3是抗体1345的hcdr3。
197、在一个实施例中,hcdr3是抗体1347的hcdr3。
198、在一个实施例中,hcdr3是抗体1350的hcdr3。
199、在一个实施例中,hcdr3是抗体1351的hcdr3。
200、在一个实施例中,hcdr3是抗体1363的hcdr3。
201、在一个实施例中,hcdr3是抗体1364的hcdr3。
202、在一个实施例中,hcdr3是抗体1397的hcdr3。
203、在一个实施例中,hcdr3是抗体1398的hcdr3。
204、在一个实施例中,hcdr3是抗体1400的hcdr3。
205、在一个实施例中,hcdr3是抗体1401的hcdr3。
206、在一个实施例中,hcdr3是抗体1402的hcdr3。
207、在一个实施例中,hcdr3是抗体1404的hcdr3。
208、在一个实施例中,hcdr3是抗体1409的hcdr3。
209、在一个实施例中,hcdr3是抗体1410的hcdr3。
210、在一个实施例中,hcdr3是抗体1412的hcdr3。
211、在一个实施例中,hcdr3是抗体1414的hcdr3。
212、在一个实施例中,hcdr3是抗体1415的hcdr3。
213、在一个实施例中,hcdr3是抗体1416的hcdr3。
214、在一个实施例中,本发明提供了抗kl49抗体,
215、其中该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49并诱导补体激活(例如,如通过基于流式细胞术的测定法所测量的),并且
216、其中该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列包含互补决定区(cdr)hcdr1、hcdr2和hcdr3,该可变轻链(vl)结构域序列包含互补决定区lcdr1、lcdr2和lcdr3,
217、其中这6个cdr是抗体1345、1347、1350、1351、1363、1364、1397、1398、1400、1401、1402、1404、1409、1410、1412、1414、1415或1416的cdr。
218、在一个实施例中,本发明提供了抗kl49抗体,
219、其中该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列包含互补决定区(cdr)hcdr1、hcdr2和hcdr3,该可变轻链(vl)结构域序列包含互补决定区lcdr1、lcdr2和lcdr3,
220、其中这6个cdr是抗体1345、1347、1350、1351、1363、1364、1397、1398、1400、1401、1402、1404、1409、1410、1412、1414、1415或1416的cdr。
221、在一个实施例中,该抗体具有抗体1345的6个cdr。
222、在一个实施例中,该抗体具有抗体1347的6个cdr。
223、在一个实施例中,该抗体具有抗体1350的6个cdr。
224、在一个实施例中,该抗体具有抗体1351的6个cdr。
225、在一个实施例中,该抗体具有抗体1363的6个cdr。
226、在一个实施例中,该抗体具有抗体1364的6个cdr。
227、在一个实施例中,该抗体具有抗体1397的6个cdr。
228、在一个实施例中,该抗体具有抗体1398的6个cdr。
229、在一个实施例中,该抗体具有抗体1400的6个cdr。
230、在一个实施例中,该抗体具有抗体1401的6个cdr。
231、在一个实施例中,该抗体具有抗体1402的6个cdr。
232、在一个实施例中,该抗体具有抗体1404的6个cdr。
233、在一个实施例中,该抗体具有抗体1409的6个cdr。
234、在一个实施例中,该抗体具有抗体1410的6个cdr。
235、在一个实施例中,该抗体具有抗体1412的6个cdr。
236、在一个实施例中,该抗体具有抗体1414的6个cdr。
237、在一个实施例中,该抗体具有抗体1415的6个cdr。
238、在一个实施例中,该抗体具有抗体1416的6个cdr。
239、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49并诱导补体激活(例如,如通过基于流式细胞术的测定法所测量的),并且
240、可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列分别包含抗体1345、1347、1350、1351、1363、1364、1397、1398、1400、1401、1402、1404、1409、1410、1412、1414、1415或1416的可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,任选地在可变重链(vh)结构域序列中的互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,并且任选地在可变轻链(vl)结构域序列中的互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
241、在一个实施例中,该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,并且其中可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列分别包含抗体1345、1347、1350、1351、1363、1364、1397、1398、1400、1401、1402、1404、1409、1410、1412、1414、1415或1416的可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,任选地在可变重链(vh)结构域序列中的互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,并且任选地在可变轻链(vl)结构域序列中的互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
242、在一个实施例中,该抗体包含抗体1345的可变重链(vh)结构域序列和抗体1345的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
243、在一个实施例中,该抗体包含抗体1347的可变重链(vh)结构域序列和抗体1347的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
244、在一个实施例中,该抗体包含抗体1350的可变重链(vh)结构域序列和抗体1350的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
245、在一个实施例中,该抗体包含抗体1351的可变重链(vh)结构域序列和抗体1351的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
246、在一个实施例中,该抗体包含抗体1363的可变重链(vh)结构域序列和抗体1363的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
247、在一个实施例中,该抗体包含抗体1364的可变重链(vh)结构域序列和抗体1364的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
248、在一个实施例中,该抗体包含抗体1397的可变重链(vh)结构域序列和抗体1397的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
249、在一个实施例中,该抗体包含抗体1398的可变重链(vh)结构域序列和抗体1398的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
250、在一个实施例中,该抗体包含抗体1400的可变重链(vh)结构域序列和抗体1400的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
251、在一个实施例中,该抗体包含抗体1401的可变重链(vh)结构域序列和抗体1401的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
252、在一个实施例中,该抗体包含抗体1402的可变重链(vh)结构域序列和抗体1402的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
253、在一个实施例中,该抗体包含抗体1404的可变重链(vh)结构域序列和抗体1404的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
254、在一个实施例中,该抗体包含抗体1409的可变重链(vh)结构域序列和抗体1409的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
255、在一个实施例中,该抗体包含抗体1410的可变重链(vh)结构域序列和抗体1410的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
256、在一个实施例中,该抗体包含抗体1412的可变重链(vh)结构域序列和抗体1412的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
257、在一个实施例中,该抗体包含抗体1414的可变重链(vh)结构域序列和抗体1414的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
258、在一个实施例中,该抗体包含抗体1415的可变重链(vh)结构域序列和抗体1415的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
259、在一个实施例中,该抗体包含抗体1416的可变重链(vh)结构域序列和抗体1416的可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变,该可变轻链(vl)结构域序列任选地在互补决定区(cdr)之外具有1、2、3、4或5个氨基酸改变。
260、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49并诱导补体激活(例如,如通过基于流式细胞术的测定法所测量的),并且该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,并且其中可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列分别包含与抗体1345、1347、1350、1351、1363、1364、1397、1398、1400、1401、1402、1404、1409、1410、1412、1414、1415或1416的可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,
261、条件是该抗体分别具有抗体1345、1347、1350、1351、1363、1364、1397、1398、1400、1401、1402、1404、1409、1410、1412、1414、1415或1416的6个cdr。
262、在一个实施例中,该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,并且其中可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列分别包含与抗体1345、1347、1350、1351、1363、1364、1397、1398、1400、1401、1402、1404、1409、1410、1412、1414、1415或1416的可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体分别具有抗体1345、1347、1350、1351、1363、1364、1397、1398、1400、1401、1402、1404、1409、1410、1412、1414、1415或1416的6个cdr。
263、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1345的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1345的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1345的6个cdr。
264、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1347的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1347的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1347的6个cdr。
265、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1350的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1350的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1350的6个cdr。
266、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1351的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1351的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1351的6个cdr。
267、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1363的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1363的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1363的6个cdr。
268、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1364的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1364的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1364的6个cdr。
269、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1397的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1397的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1397的6个cdr。
270、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1398的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1398的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1398的6个cdr。
271、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1400的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1400的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1400的6个cdr。
272、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1401的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1401的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1401的6个cdr。
273、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1402的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1402的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1402的6个cdr。
274、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1404的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1404的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1404的6个cdr。
275、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1409的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1409的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1409的6个cdr。
276、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1410的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1410的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1410的6个cdr。
277、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1412的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1412的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1412的6个cdr。
278、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1414的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1414的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1414的6个cdr。
279、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1415的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1415的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1415的6个cdr。
280、在一个实施例中,可变重链(vh)结构域序列包含与抗体1416的vh结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,并且可变轻链(vl)结构域序列包含与抗体1416的vl结构域序列具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%同一性的序列,条件是该抗体具有抗体1416的6个cdr。
281、在一个实施例中,本发明提供了一种特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49的抗体,
282、其中该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,并且其中可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列分别包含抗体1345、1347、1350、1351、1363、1364、1397、1398、1400、1401、1402、1404、1409、1410、1412、1414、1415或1416的可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列。
283、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49,其中该抗体包含抗体1345的vh和vl结构域序列。
284、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49,其中该抗体包含抗体1347的vh和vl结构域序列。
285、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49,其中该抗体包含抗体1350的vh和vl结构域序列。
286、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49,其中该抗体包含抗体1351的vh和vl结构域序列。
287、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49,其中该抗体包含抗体1363的vh和vl结构域序列。
288、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49,其中该抗体包含抗体1364的vh和vl结构域序列。
289、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49,其中该抗体包含抗体1397的vh和vl结构域序列。
290、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49,其中该抗体包含抗体1398的vh和vl结构域序列。
291、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49,其中该抗体包含抗体1400的vh和vl结构域序列。
292、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49,其中该抗体包含抗体1401的vh和vl结构域序列。
293、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49,其中该抗体包含抗体1402的vh和vl结构域序列。
294、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49,其中该抗体包含抗体1404的vh和vl结构域序列。
295、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49,其中该抗体包含抗体1409的vh和vl结构域序列。
296、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49,其中该抗体包含抗体1410的vh和vl结构域序列。
297、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49,其中该抗体包含抗体1412的vh和vl结构域序列。
298、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49,其中该抗体包含抗体1414的vh和vl结构域序列。
299、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49,其中该抗体包含抗体1415的vh和vl结构域序列。
300、在一个实施例中,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49,其中该抗体包含抗体1416的vh和vl结构域序列。
301、在一个实施例中,该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,并且其中可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列分别包含抗体1345、1347、1350、1351、1363、1364、1397、1398、1400、1401、1402、1404、1409、1410、1412、1414、1415或1416的可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列。
302、在一个实施例中,该抗体包含抗体1345的vh结构域序列和vl结构域序列。
303、在一个实施例中,该抗体包含抗体1347的vh结构域序列和vl结构域序列。
304、在一个实施例中,该抗体包含抗体1350的vh结构域序列和vl结构域序列。
305、在一个实施例中,该抗体包含抗体1351的vh结构域序列和vl结构域序列。
306、在一个实施例中,该抗体包含抗体1363的vh结构域序列和vl结构域序列。
307、在一个实施例中,该抗体包含抗体1364的vh结构域序列和vl结构域序列。
308、在一个实施例中,该抗体包含抗体1397的vh结构域序列和vl结构域序列。
309、在一个实施例中,该抗体包含抗体1398的vh结构域序列和vl结构域序列。
310、在一个实施例中,该抗体包含抗体1400的vh结构域序列和vl结构域序列。
311、在一个实施例中,该抗体包含抗体1401的vh结构域序列和vl结构域序列。
312、在一个实施例中,该抗体包含抗体1402的vh结构域序列和vl结构域序列。
313、在一个实施例中,该抗体包含抗体1404的vh结构域序列和vl结构域序列。
314、在一个实施例中,该抗体包含抗体1409的vh结构域序列和vl结构域序列。
315、在一个实施例中,该抗体包含抗体1410的vh结构域序列和vl结构域序列。
316、在一个实施例中,该抗体包含抗体1412的vh结构域序列和vl结构域序列。
317、在一个实施例中,该抗体包含抗体1414的vh结构域序列和vl结构域序列。
318、在一个实施例中,该抗体包含抗体1415的vh结构域序列和vl结构域序列。
319、在一个实施例中,该抗体包含抗体1416的vh结构域序列和vl结构域序列。
320、在一个实例中,抗体选自由抗体1345、1347、1350、1351、1363、1364、1397、1398、1400、1401、1402、1404、1409、1410、1412、1414、1415和1416组成的组。
321、在一个实施例中,该抗体是抗体1345。
322、在一个实施例中,该抗体是抗体1347。
323、在一个实施例中,该抗体是抗体1350。
324、在一个实施例中,该抗体是抗体1351。
325、在一个实施例中,该抗体是抗体1363。
326、在一个实施例中,该抗体是抗体1364。
327、在一个实施例中,该抗体是抗体1397。
328、在一个实施例中,该抗体是抗体1398。
329、在一个实施例中,该抗体是抗体1400。
330、在一个实施例中,该抗体是抗体1401。
331、在一个实施例中,该抗体是抗体1402。
332、在一个实施例中,该抗体是抗体1404。
333、在一个实施例中,该抗体是抗体1409。
334、在一个实施例中,该抗体是抗体1410。
335、在一个实施例中,该抗体是抗体1412。
336、在一个实施例中,该抗体是抗体1414。
337、在一个实施例中,该抗体是抗体1415。
338、在一个实施例中,该抗体是抗体1416。
339、提供了与本文任何地方描述的抗体结合kl49上相同表位的抗体。
340、提供了与抗体1345、1347、1350、1351、1363、1364、1397、1398、1400、1401、1402、1404、1409、1410、1412、1414、1415或1416(例如由其vh和vl序列定义)结合相同表位的抗体。
341、在一个实施例中,提供了与抗体1345(例如由其vh和vl序列定义)结合相同表位的抗体。
342、在一个实施例中,提供了与抗体1347(例如由其vh和vl序列定义)结合相同表位的抗体。
343、在一个实施例中,提供了与抗体1350(例如由其vh和vl序列定义)结合相同表位的抗体。
344、在一个实施例中,提供了与抗体1351(例如由其vh和vl序列定义)结合相同表位的抗体。
345、在一个实施例中,提供了与抗体1363(例如由其vh和vl序列定义)结合相同表位的抗体。
346、在一个实施例中,提供了与抗体1364(例如由其vh和vl序列定义)结合相同表位的抗体。
347、在一个实施例中,提供了与抗体1397(例如由其vh和vl序列定义)结合相同表位的抗体。
348、在一个实施例中,提供了与抗体1398(例如由其vh和vl序列定义)结合相同表位的抗体。
349、在一个实施例中,提供了与抗体1400(例如由其vh和vl序列定义)结合相同表位的抗体。
350、在一个实施例中,提供了与抗体1401(例如由其vh和vl序列定义)结合相同表位的抗体。
351、在一个实施例中,提供了与抗体1402(例如由其vh和vl序列定义)结合相同表位的抗体。
352、在一个实施例中,提供了与抗体1404(例如由其vh和vl序列定义)结合相同表位的抗体。
353、在一个实施例中,提供了与抗体1409(例如由其vh和vl序列定义)结合相同表位的抗体。
354、在一个实施例中,提供了与抗体1410(例如由其vh和vl序列定义)结合相同表位的抗体。
355、在一个实施例中,提供了与抗体1412(例如由其vh和vl序列定义)结合相同表位的抗体。
356、在一个实施例中,提供了与抗体1414(例如由其vh和vl序列定义)结合相同表位的抗体。
357、在一个实施例中,提供了与抗体1415(例如由其vh和vl序列定义)结合相同表位的抗体。
358、在一个实施例中,提供了与抗体1416(例如由其vh和vl序列定义)结合相同表位的抗体。
359、抗体可与具有与本文任何地方披露的抗体的足迹完全或部分重叠的足迹的kl49接触。如本文其他地方所述,可例如使用spr来确定抗体之间的竞争,并且提供与本文任何地方所述的igg抗体竞争结合kl49(竞争结合它们的表位)的抗体。
360、本发明的抗体可以是与本文所述的任何抗kl49抗体(诸如抗体1345、1347、1350、1351、1363、1364、1397、1398、1400、1401、1402、1404、1409、1410、1412、1414、1415和1416,例如由它们各自的vh和vl序列定义)竞争结合kl49的抗体。
361、本发明的抗体可以是与抗体1345竞争结合kl49的抗体。
362、本发明的抗体可以是与抗体1347竞争结合kl49的抗体。
363、本发明的抗体可以是与抗体1350竞争结合kl49的抗体。
364、本发明的抗体可以是与抗体1351竞争结合kl49的抗体。
365、本发明的抗体可以是与抗体1363竞争结合kl49的抗体。
366、本发明的抗体可以是与抗体1364竞争结合kl49的抗体。
367、本发明的抗体可以是与抗体1397竞争结合kl49的抗体。
368、本发明的抗体可以是与抗体1398竞争结合kl49的抗体。
369、本发明的抗体可以是与抗体1400竞争结合kl49的抗体。
370、本发明的抗体可以是与抗体1401竞争结合kl49的抗体。
371、本发明的抗体可以是与抗体1402竞争结合kl49的抗体。
372、本发明的抗体可以是与抗体1404竞争结合kl49的抗体。
373、本发明的抗体可以是与抗体1409竞争结合kl49的抗体。
374、本发明的抗体可以是与抗体1410竞争结合kl49的抗体。
375、本发明的抗体可以是与抗体1412竞争结合kl49的抗体。
376、本发明的抗体可以是与抗体1414竞争结合kl49的抗体。
377、本发明的抗体可以是与抗体1415竞争结合kl49的抗体。
378、本发明的抗体可以是与抗体1416竞争结合kl49的抗体。
379、本发明提供的核酸序列可以包含编码如本文任何地方所定义的抗kl49抗体的vh结构域和/或vl结构域的序列。
380、该核酸可以包含编码抗体1345的vh结构域和/或vl结构域的序列。
381、该核酸可以包含编码抗体1347的vh结构域和/或vl结构域的序列。
382、该核酸可以包含编码抗体1350的vh结构域和/或vl结构域的序列。
383、该核酸可以包含编码抗体1351的vh结构域和/或vl结构域的序列。
384、该核酸可以包含编码抗体1363的vh结构域和/或vl结构域的序列。
385、该核酸可以包含编码抗体1364的vh结构域和/或vl结构域的序列。
386、该核酸可以包含编码抗体1397的vh结构域和/或vl结构域的序列。
387、该核酸可以包含编码抗体1398的vh结构域和/或vl结构域的序列。
388、该核酸可以包含编码抗体1400的vh结构域和/或vl结构域的序列。
389、该核酸可以包含编码抗体1401的vh结构域和/或vl结构域的序列。
390、该核酸可以包含编码抗体1402的vh结构域和/或vl结构域的序列。
391、该核酸可以包含编码抗体1404的vh结构域和/或vl结构域的序列。
392、该核酸可以包含编码抗体1409的vh结构域和/或vl结构域的序列。
393、该核酸可以包含编码抗体1410的vh结构域和/或vl结构域的序列。
394、该核酸可以包含编码抗体1412的vh结构域和/或vl结构域的序列。
395、该核酸可以包含编码抗体1414的vh结构域和/或vl结构域的序列。
396、该核酸可以包含编码抗体1415的vh结构域和/或vl结构域的序列。
397、该核酸可以包含编码抗体1416的vh结构域和/或vl结构域的序列。
398、3.4抗体—概述
399、在一个实施例中,如本文任何地方所定义的抗体显示补体依赖性细胞毒性活性(cdc)活性。
400、如本文任何地方所定义的抗体可以是人igg1或人igg4。在一个实施例中,该抗体是人igg1。在一个实施例中,该抗体是包含恒定区序列seq id no:418的人igg1。在一个实施例中,该抗体是人igg4。在一个实施例中,该抗体是包含恒定区序列seq id no:436的人igg4。
401、如本文任何地方所定义的抗体可以是人iga1(例如,包含恒定区序列seq id no:484)或人iga2(例如,包含恒定区序列seq id no:485)。
402、如本文任何地方所定义的抗体可以包含κ(kappa)轻链恒定区,优选恒定结构域序列seq id no:448。本发明提供了一种载体,该载体包含如本文任何地方所定义的核酸;任选地,其中该载体是cho载体。
403、本发明提供了一种宿主细胞,该宿主细胞包含如本文任何地方所定义的核酸或如本文任何地方所定义的载体。
404、本发明提供了一种药物组合物,该药物组合物包含如本文任何地方所定义的抗体和药学上可接受的赋形剂。
405、本发明提供了一种药物组合物,该药物组合物包含编码如本文任何地方所定义的抗体的分离核酸,或如本文任何地方所定义的分离核酸,以及药学上可接受的赋形剂。
406、在一个实施例中,该药物组合物被配制用于通过注射施用。
407、在一个实施例中,该药物组合物被配制用于静脉内、肌内或皮下施用。
408、在一个实施例中,该药物组合物进一步包含至少一种另外的治疗剂。
409、在一个实施例中,该另外的治疗剂是至少一种、优选地一种或两种另外的抗体。
410、在一个实施例中,该另外的治疗剂是碳青霉烯。
411、在一个实施例中,该另外的治疗剂是粘菌素。
412、在一个实施例中,该药物组合物包含特异性结合oxa-23的第一抗体和特异性结合oc1 los的第二抗体。
413、在一个实施例中,该药物组合物包含特异性结合oxa-23的第一抗体和特异性结合kl49的第二抗体。
414、在一个实施例中,该药物组合物包含特异性结合oc1 los的第一抗体和特异性结合kl49的第二抗体。
415、在一个实施例中,该药物组合物包含特异性结合oxa-23的第一抗体、特异性结合oc1 los的第二抗体和特异性结合kl49的第三抗体。
416、本发明提供了一种诊断试剂盒,该诊断试剂盒包含至少一种如本文任何地方所定义的抗体。在一个实施例中,该诊断试剂盒包含特异性结合oxa-23的第一抗体和特异性结合oc1 los的第二抗体。在一个实施例中,该诊断试剂盒包含特异性结合oxa-23的第一抗体和特异性结合kl49的第二抗体。在一个实施例中,该诊断试剂盒包含特异性结合oc1 los的第一抗体和特异性结合kl49的第二抗体。在一个实施例中,该诊断试剂盒包含特异性结合oxa-23的第一抗体、特异性结合oc1 los的第二抗体和特异性结合kl49的第三抗体。
417、本发明提供了一种试剂盒,该试剂盒包含如本文任何地方所定义的药物组合物。在一个实施例中,该试剂盒进一步包含至少一种另外的治疗剂。在一个实施例中,该另外的治疗剂是包含至少一种、优选地一种或两种另外的抗体的另外的药物组合物。在一个实施例中,该试剂盒进一步包含碳青霉烯。在一个实施例中,该试剂盒进一步包含粘菌素。
418、在一个实施例中,该至少一种另外的抗体选自:特异性结合oxa-23的抗体,特异性结合oc1 los的抗体,以及特异性结合kl49的抗体。
419、在一个实施例中,该试剂盒包含特异性结合oxa-23的第一抗体和特异性结合oc1los的第二抗体。
420、在一个实施例中,该试剂盒包含特异性结合oxa-23的第一抗体和特异性结合kl49的第二抗体。
421、在一个实施例中,该试剂盒包含特异性结合oc1 los的第一抗体和特异性结合kl49的第二抗体。
422、在一个实施例中,该试剂盒包含特异性结合oxa-23的第一抗体、特异性结合oc1los的第二抗体和特异性结合kl49的第三抗体。
423、在一个实施例中,该试剂盒进一步包含用于预防和/或治疗人的由鲍氏不动杆菌引起的细菌感染的标签或说明书;任选地,其中该标签或说明书包括上市许可号(例如,fda或ema许可号);任选地,其中该试剂盒包括含有该抗体的iv装置或注射装置。优选地,抗体包含在密封容器中。
424、任选地,该试剂盒包含用于同时、分开或顺序施用其中的治疗剂的说明书。
425、可以提供如本文任何地方所定义的抗体或如本文任何地方所定义的组合物以用作药物。
426、可以提供如本文任何地方所定义的抗体或如本文任何地方所定义的组合物以用于治疗由鲍氏不动杆菌引起的细菌感染的方法,所述方法包括向患者施用该抗体或组合物。
427、可以提供如本文任何地方所定义的抗体或如本文任何地方所定义的组合物以用于预防由鲍氏不动杆菌引起的细菌感染的方法,所述方法包括向患者施用该抗体或组合物。
428、当将如本文任何地方所定义的特异性结合oxa-23的抗体施用于患者时,可能已经在该患者的样品中确定了存在oxa-23,尽管这并不是必需的。
429、当将如本文任何地方所定义的特异性结合oc1 los的抗体施用于患者时,可能已经在该患者的样品中确定了存在oc1 los,尽管这并不是必需的。
430、当将如本文任何地方所定义的特异性结合kl49的抗体施用于患者时,可能已经在该患者的样品中确定了存在kl49,尽管这并不是必需的。
431、还提供了如本文任何地方所定义的抗体、或如本文任何地方所定义的组合物在制造药物中的用途,该药物用于在治疗由鲍氏不动杆菌引起的细菌感染的方法中使用。
432、还提供了如本文任何地方所定义的抗体、或如本文任何地方所定义的组合物在制造药物中的用途,该药物用于在预防由鲍氏不动杆菌引起的细菌感染的方法中使用。
433、本发明提供了一种治疗患者的由鲍氏不动杆菌引起的细菌感染的方法,该方法包括向所述患者施用治疗有效量的如本文任何地方所定义的抗体或如本文任何地方所定义的组合物。
434、本发明提供了一种预防患者的由鲍氏不动杆菌引起的细菌感染的方法,该方法包括向所述患者施用治疗有效量的如本文任何地方所定义的抗体或如本文任何地方所定义的组合物。
435、在一个实施例中,由鲍氏不动杆菌引起的细菌感染是由鲍氏不动杆菌引起的院内细菌感染。
436、在一个实施例中,患者患有下呼吸道感染,例如肺炎。
437、在一个实施例中,患者患有败血症。
438、在一个实施例中,患者患有菌血症。
439、在一个实施例中,该方法进一步包括施用至少一种另外的治疗剂。
440、在一个实施例中,该另外的治疗剂的施用是同时的、分开的或顺序的。
441、在一个实施例中,该另外的治疗剂是至少一种、优选地一种或两种另外的抗体。
442、在一个实施例中,该方法包括施用特异性结合oxa-23的第一抗体和特异性结合oc1 los的第二抗体。
443、在一个实施例中,该方法包括施用特异性结合oxa-23的第一抗体和特异性结合kl49的第二抗体。
444、在一个实施例中,该方法包括施用特异性结合oc1 los的第一抗体和特异性结合kl49的第二抗体。
445、在一个实施例中,该方法包括施用特异性结合oxa-23的第一抗体、特异性结合oc1los的第二抗体和特异性结合kl49的第三抗体。
446、在一个实施例中,该方法进一步包括施用碳青霉烯。
447、在一个实施例中,该方法进一步包括施用粘菌素。
448、还提供了如本文任何地方所定义的抗体用于确定样品中存在或不存在鲍氏不动杆菌的用途。确定样品中存在鲍氏不动杆菌可用于诊断患者的由鲍氏不动杆菌引起的感染。
449、还提供了一种确定样品中存在或不存在鲍氏不动杆菌的方法,该方法可以包括将样品与如本文任何地方所定义的抗体接触;以及测试抗体与样品中的鲍氏不动杆菌之间的结合;其中检测到结合表明样品中存在鲍氏不动杆菌,并且其中不存在结合表明样品中不存在鲍氏不动杆菌。
450、还提供了如本文任何地方所定义的特异性结合oxa-23的抗体用于确定样品中存在或不存在oxa-23的用途。确定样品中存在oxa-23可用于确定患者的治疗方案。例如,如果确定了患者的样品中存在oxa-23,则可以确定该患者用特异性结合oxa-23的抗体治疗。患者可能已经或可能没有被诊断为感染了鲍氏不动杆菌。
451、还提供了如本文任何地方所定义的特异性结合oc1 los的抗体用于确定样品中存在或不存在oc1 los的用途。确定样品中存在oc1 los可用于确定患者的治疗方案。例如,如果确定了患者的样品中存在oc1 los,则可以确定该患者用特异性结合oc1 los的抗体治疗。患者可能已经或可能没有被诊断为感染了鲍氏不动杆菌。
452、还提供了如本文任何地方所定义的特异性结合kl49的抗体用于确定样品中存在或不存在kl49的用途。确定样品中存在kl49可用于确定患者的治疗方案。例如,如果确定了患者的样品中存在kl49,则可以确定该患者用特异性结合kl49的抗体治疗。患者可能已经或可能没有被诊断为感染了鲍氏不动杆菌。
453、在一个实施例中,抗体与可检测标记物缀合。
454、在一个实施例中,样品是从已经或怀疑已经感染鲍氏不动杆菌的人获得的。在一个实施例中,样品是从已经或怀疑已经感染鲍氏不动杆菌的表现出一种或多种细菌感染症状的人获得的。在一个实施例中,样品是血清、血浆或全血样品、口腔或鼻拭子、尿液、粪便或脑脊液(cfs),或者其中样品来自任何疑似鲍氏不动杆菌感染的器官或组织。
455、提供了一种诊断试剂盒,用于如本文任何地方所定义的用途或如本文任何地方所定义的方法。该诊断试剂盒可以包含如本文任何地方所定义的抗体和任选的一种或多种缓冲溶液。在一个实施例中,该诊断试剂盒包括第一试剂和第二试剂,该第一试剂包含如本文任何地方所定义的抗体,该第二试剂包含结合第一试剂的检测分子。在一个实施例中,检测分子是包含可检测标记物或与可检测标记物缀合的抗体。
456、4.附图
457、图1a.ho chi minh icu中gc2鲍氏不动杆菌分离株的时间分辨核心基因组系统发育。阴影表示icu中使用碳青霉烯抗生素亚胺培南进行vap经验治疗的时间段。标记的a-e是gc2的五个耐碳青霉烯的基因组子分支。右侧还列出了针对omv产生进行测试的10个菌株的荚膜k基因座亚型。用星号(*)标记的是成功产生omv并将其用于免疫kymabintellisellect转基因小鼠的4个菌株。
458、图1b.用于免疫的鲍氏不动杆菌临床分离株产生的未固定omv制剂的扫描电子显微镜图像。从鲍氏不动杆菌bal_191、bal_276、bal_215和bal_084制备的omv。该制剂中约95%的omv的直径在25-70nm之间,而直径>80nm的较大omv占制剂的2%。另外,还可以观察到无定形结构,并且该无定形结构占制剂的3%。
459、图2a.用于omv免疫的方案。10只小鼠在研究的第0天接受了约1μgomv的初免剂量。随后,将小鼠分成2个研究组,在第7天处死第1组中的5只小鼠,收获其脾脏和淋巴结。第2组中的5只小鼠在第36天接受了另外的加强,然后在第43天被处死。在初免剂量和加强剂量之前以及在第7天采集血液。通过elisa评估这些血清对免疫omv的反应性。可以使用intelliselect筛选技术分析第7天收获的器官与第43天收获的器官的b细胞反应。pb=预取血;sb=连续取血;tb=终点取血。
460、图2b.用4种gc2鲍氏不动杆菌omv的混合池免疫的kymab intellisellect转基因小鼠对免疫omv的多克隆血清反应,如通过elisa所确定的。(a)用于免疫的4种gc2鲍氏不动杆菌omv的抗原特异性igg1反应的动力学。对用于免疫的4种单独的gc2鲍氏不动杆菌omv(以粗体显示的bal_084、bal_191、bal_215和bal_276)的总抗原特异性igg1反应与对在研究的第43天免疫池中不存在的另外2种gc2鲍氏不动杆菌omv(bal_339和bal_377)的反应相当。所有免疫小鼠的特异性igg1反应相当,并且所有人ig同种型均由多克隆血清中存在的特异性抗体代表。已相对于初免之前采集的预取血计算了抗原特异性相对终点滴定度。
461、图3.用于从gc2 crab omv免疫小鼠的脾脏中分选抗原特异性igg+b细胞的门控策略。
462、图4a.从用gc2 crab omv免疫的4只kymab intellisellect转基因小鼠的脾脏回收的951对vh和vl链序列的太阳黑子图。每个vh和vl配对序列用一个圆圈表示,根据其来源的单个小鼠着色。推断源自共同b细胞祖细胞的谱系内的序列通过黑线连接。
463、图4b.指示igh&l配对序列的数量、映射到高质量序列并分配到指示对免疫原的积极进化的b细胞反应的相关序列簇的比例的表。
464、图5a.mab结合gc2鲍氏不动杆菌omv和完整的、未固定的细菌细胞的比较,如通过elisa所确定的。在两种elisa结合测定中鉴定为结合剂的mab:以高于图上所示的测定阈值的水平结合完整的、未固定的gc2鲍氏不动杆菌细菌细胞和omv两者的mab以绿色表示。橙色是仅结合完整的、未固定的细菌细胞的2种mab。无法结合完整细菌细胞壁的mab以白色表示。
465、图5b.基于完整细菌细胞壁的结合和引发c3b沉积的能力选择用于cho表达和纯化的mab,如上所述。用于后续cho表达的选择实例以粗体显示。
466、图7a.指示每种mab的所鉴定靶标的表。使用的方法包括从hci收集系统发育信息(见上文)、使用基因组噬菌体文库进行血清学表达克隆(sec)以及用特异性mab进行蛋白质印迹(wb)。在鲍氏不动杆菌的体内挑战模型中测试以粗体(*)表示的mab,以证明治疗功效。
467、图7b.示例蛋白质印迹分析揭示了mab结合以下三种不同靶标:高分子量靶标(kl49荚膜—上图)、10kd靶标(oc1 los—中图)和30kd蛋白质(oxa-23—下图)。
1.一种抗体,该抗体特异性结合在鲍氏不动杆菌细菌的表面处。
2.根据权利要求1所述的抗体,其中该抗体诱导补体激活(例如,如通过基于流式细胞术的测定法所测量的)。
3.根据权利要求1或权利要求2所述的抗体,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的oxa-23。
4.根据权利要求1或权利要求2所述的抗体,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的外膜囊泡(omv)上的oxa-23。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的抗体,其中该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列包含互补决定区(cdr)hcdr1、hcdr2和hcdr3,该可变轻链(vl)结构域序列包含互补决定区lcdr1、lcdr2和lcdr3,并且其中该hcdr3选自由seq id no:34、seq id no:24、seq id no:174和seq id no:182组成的组。
6.根据权利要求1至4中任一项所述的抗体,其中该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列包含互补决定区(cdr)hcdr1、hcdr2和hcdr3,该可变轻链(vl)结构域序列包含互补决定区lcdr1、lcdr2和lcdr3,并且其中:
7.根据权利要求1至4中任一项所述的抗体,其中该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,并且其中:
8.根据权利要求1至4中任一项所述的抗体,其中该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,并且其中:
9.根据权利要求1至4中任一项所述的抗体,其中该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,并且其中:
10.一种抗体,该抗体与根据权利要求1至9中任一项所述的抗体结合oxa-23上的相同表位。
11.一种抗体,该抗体能够与根据权利要求1至9中任一项所述的抗体竞争结合oxa-23。
12.根据权利要求1或权利要求2所述的抗体,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的ocl1脂寡糖(los)。
13.根据权利要求1或权利要求2所述的抗体,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的外膜囊泡(omv)上的ocl1 los。
14.根据权利要求12或权利要求13所述的抗体,其中该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列包含互补决定区(cdr)hcdr1、hcdr2和hcdr3,该可变轻链(vl)结构域序列包含互补决定区lcdr1、lcdr2和lcdr3,并且其中该hcdr3选自由seq id no:189、seq id no:196、seq id no:90、seq id no:105、seq id no:112、seq id no:119和seq id no:146组成的组。
15.根据权利要求12或权利要求13所述的抗体,其中该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列包含互补决定区(cdr)hcdr1、hcdr2和hcdr3,该可变轻链(vl)结构域序列包含互补决定区lcdr1、lcdr2和lcdr3,并且其中:
16.根据权利要求12或权利要求13所述的抗体,其中该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,并且其中:
17.根据权利要求12或权利要求13所述的抗体,其中该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,并且其中:
18.根据权利要求12或权利要求13所述的抗体,其中该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,并且其中:
19.一种抗体,该抗体与根据权利要求12至18中任一项所述的抗体结合ocl1 los上的相同表位。
20.一种抗体,该抗体能够与根据权利要求12至18中任一项所述的抗体竞争结合ocl1los。
21.根据权利要求1或权利要求2所述的抗体,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的表面处的kl49。
22.根据权利要求1或权利要求2所述的抗体,该抗体特异性结合鲍氏不动杆菌细菌的外膜囊泡(omv)上的kl49。
23.根据权利要求21或权利要求22所述的抗体,其中该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列包含互补决定区(cdr)hcdr1、hcdr2和hcdr3,该可变轻链(vl)结构域序列包含互补决定区lcdr1、lcdr2和lcdr3,并且其中该hcdr3选自由seq id no:168、seq id no:5、seq id no:14、seq id no:41、seqid no:45、seq id no:50、seq id no:55、seq id no:62、seq id no:67、seq id no:72、seqid no:77、seq id no:83、seq id no:98、seq id no:126、seq id no:132、seq id no:139、seq id no:156和seq id no:163组成的组。
24.根据权利要求21或权利要求22所述的抗体,其中该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,该可变重链(vh)结构域序列包含互补决定区(cdr)hcdr1、hcdr2和hcdr3,该可变轻链(vl)结构域序列包含互补决定区lcdr1、lcdr2和lcdr3,并且其中:
25.根据权利要求21或权利要求22所述的抗体,其中该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,并且其中:
26.根据权利要求21或权利要求22所述的抗体,其中该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,并且其中:
27.根据权利要求21或权利要求22所述的抗体,其中该抗体包含可变重链(vh)结构域序列和可变轻链(vl)结构域序列,并且其中:
28.一种抗体,该抗体与根据权利要求21至27中任一项所述的抗体结合kl49上的相同表位。
29.一种抗体,该抗体能够与根据权利要求21至27中任一项所述的任何抗体竞争结合kl49。
30.根据前述权利要求中任一项所述的抗体,其中该抗体显示补体依赖性细胞毒性活性(cdc)活性。
31.根据前述权利要求中任一项所述的抗体,其中该抗体是人igg1或人igg4。
32.根据权利要求31所述的抗体,其中该抗体是人igg1,任选地其中该抗体包含seq idno:418的恒定区序列。
33.根据权利要求31所述的抗体,其中该抗体是人igg4,任选地其中该抗体包含seq idno:436的恒定区序列。
34.根据权利要求1至30中任一项所述的抗体,其中该抗体是人iga1(例如,包含恒定区序列seq id no:484)或人iga2(例如,包含恒定区序列seq id no:485)。
35.根据权利要求1至34中任一项所述的抗体,其中该抗体包含κ(kappa)轻链恒定区,优选恒定结构域序列seq id no:448。
36.一种核酸序列,该核酸序列包含编码根据任一前述权利要求所述的抗体的vh结构域和/或vl结构域的序列。
37.一种核酸序列,该核酸序列包含编码根据任一前述权利要求所述的抗体的重链和/或轻链的序列。
38.一种载体,该载体包含根据权利要求36或权利要求37所述的核酸,任选地其中该载体是cho载体。
39.一种宿主细胞,该宿主细胞包含根据权利要求36或权利要求37所述的核酸或根据权利要求38所述的载体。
40.一种药物组合物,该药物组合物包含(i)编码根据权利要求1至35中任一项所述的抗体的分离的核酸,或(ii)根据权利要求36或权利要求37所述的核酸,以及药学上可接受的赋形剂。
41.一种药物组合物,该药物组合物包含根据权利要求1至35中任一项所述的抗体和药学上可接受的赋形剂。
42.根据权利要求40或41所述的药物组合物,其中该药物组合物被配制用于静脉内、肌内或皮下施用。
43.根据权利要求40至42中任一项所述的药物组合物,其中该药物组合物进一步包含至少一种另外的治疗剂。
44.根据权利要求43所述的药物组合物,其中该另外的治疗剂是至少一种、优选地一种或两种另外的抗体。
45.根据权利要求43所述的药物组合物,其中该另外的治疗剂是碳青霉烯。
46.根据权利要求43所述的药物组合物,其中该另外的治疗剂是粘菌素。
47.一种试剂盒,该试剂盒包含根据权利要求1至35中任一项所述的抗体。
48.一种试剂盒,该试剂盒包含根据权利要求40至46中任一项所述的药物组合物。
49.根据权利要求48所述的试剂盒,其中该试剂盒进一步包含用于预防和/或治疗人的由鲍氏不动杆菌引起的细菌感染的标签或说明书;任选地,其中该标签或说明书包括上市许可号(例如,fda或ema许可号);任选地,其中该试剂盒包括含有该抗体的iv装置或注射装置。
50.根据权利要求47或权利要求49所述的试剂盒,其中该抗体包含在密封容器中。
51.根据权利要求1至35中任一项所述的抗体、或根据权利要求40至46中任一项所述的药物组合物、或根据权利要求36或权利要求37所述的核酸,用作药物。
52.根据权利要求1至35中任一项所述的抗体、或根据权利要求40至46中任一项所述的药物组合物、或根据权利要求36或权利要求37所述的核酸,用于在治疗由鲍氏不动杆菌引起的细菌感染的方法中使用,所述方法包括向患者施用该抗体、组合物或核酸。
53.根据权利要求1至35中任一项所述的抗体、或根据权利要求40至46中任一项所述的药物组合物、或根据权利要求36或权利要求37所述的核酸,用于在预防由鲍氏不动杆菌引起的细菌感染的方法中使用,所述方法包括向患者施用该抗体、组合物或核酸。
54.根据权利要求1至35中任一项所述的抗体、或根据权利要求40至46中任一项所述的药物组合物、或根据权利要求36或权利要求37所述的核酸,用于根据权利要求52或权利要求53所述使用,其中在向该患者施用该抗体、组合物或核酸之前,已经确定该患者的样品中存在或不存在oxa-23。
55.根据权利要求1至35中任一项所述的抗体、或根据权利要求40至46中任一项所述的药物组合物、或根据权利要求36或权利要求37所述的核酸,用于根据权利要求52、权利要求53或权利要求54所述使用,其中在向该患者施用该抗体、组合物或核酸之前,已经确定该患者的样品中存在或不存在ocl1 los。
56.根据权利要求1至35中任一项所述的抗体、或根据权利要求40至46中任一项所述的药物组合物、或根据权利要求36或权利要求37所述的核酸,用于根据权利要求52至55中任一项所述使用,其中在向该患者施用该抗体、组合物或核酸之前,已经确定该患者的样品中存在或不存在kl49。
57.根据权利要求1至35中任一项所述的抗体、或根据权利要求40至46中任一项所述的药物组合物、或根据权利要求36或权利要求37所述的核酸在制造药物中的用途,该药物用于在治疗患者的由鲍氏不动杆菌引起的细菌感染的方法中使用。
58.根据权利要求1至35中任一项所述的抗体、或根据权利要求40至46中任一项所述的药物组合物、或根据权利要求36或权利要求37所述的核酸在制造药物中的用途,该药物用于在预防患者的由鲍氏不动杆菌引起的细菌感染的方法中使用。
59.一种治疗患者的由鲍氏不动杆菌引起的细菌感染的方法,该方法包括向所述患者施用治疗有效量的根据权利要求1至35中任一项所述的抗体、或根据权利要求40至46中任一项所述的药物组合物、或根据权利要求36或权利要求37所述的核酸。
60.一种预防患者的由鲍氏不动杆菌引起的细菌感染的方法,该方法包括向所述患者施用治疗有效量的根据权利要求1至35中任一项所述的抗体、或根据权利要求40至46中任一项所述的药物组合物、或根据权利要求36或权利要求37所述的核酸。
61.根据权利要求52至56中任一项所述用于使用的抗体、组合物或核酸、根据权利要求57或权利要求58所述的用途、或根据权利要求59或权利要求60所述的方法,其中该由鲍氏不动杆菌引起的细菌感染是由鲍氏不动杆菌引起的院内细菌感染。
62.根据权利要求52至56中任一项所述用于使用的抗体、组合物或核酸、根据权利要求57或权利要求58所述的用途、或根据权利要求59或权利要求60所述的方法,其中该患者患有下呼吸道感染,例如肺炎。
63.根据权利要求52至56中任一项所述用于使用的抗体、组合物或核酸、根据权利要求57或权利要求58所述的用途、或根据权利要求59或权利要求60所述的方法,其中该患者患有败血症。
64.根据权利要求52至56中任一项所述用于使用的抗体、组合物或核酸、根据权利要求57或权利要求58所述的用途、或根据权利要求59或权利要求60所述的方法,其中该患者患有菌血症。
65.根据权利要求52至56中任一项所述用于使用的抗体、组合物或核酸、根据权利要求57或权利要求58所述的用途、或根据权利要求59或权利要求60所述的方法,其中该方法进一步包括施用至少一种另外的治疗剂。
66.根据权利要求65所述用于使用的抗体、组合物或核酸、根据权利要求65所述的用途、或根据权利要求65所述的方法,其中该另外的治疗剂的施用是同时的、分开的或顺序的。
67.根据权利要求65或权利要求66所述用于使用的抗体、组合物或核酸、根据权利要求65或权利要求66所述的用途、或根据权利要求65或权利要求66所述的方法,其中该另外的治疗剂是至少一种、优选地一种或两种另外的抗体。
68.根据权利要求65至67中任一项所述用于使用的抗体、组合物或核酸、根据权利要求65至67中任一项所述的用途、或根据权利要求65至67中任一项所述的方法,其中该至少一种另外的治疗剂是碳青霉烯。
69.根据权利要求65至67中任一项所述用于使用的抗体、组合物或核酸、根据权利要求65至67中任一项所述的用途、或根据权利要求65至67中任一项所述的方法,其中该至少一种另外的治疗剂是粘菌素。
70.根据权利要求1至35中任一项所述的抗体用于确定样品中存在或不存在鲍氏不动杆菌的用途。
71.一种确定样品中存在或不存在鲍氏不动杆菌的方法,该方法包括使该样品与根据1至35中任一项所述的抗体接触;以及测试该抗体与该样品中的鲍氏不动杆菌之间的结合;其中检测到结合表明该样品中存在鲍氏不动杆菌,并且其中不存在结合表明该样品中不存在鲍氏不动杆菌。
72.根据权利要求1至11中任一项所述的抗体用于确定样品中存在或不存在oxa-23的用途,任选地其中确定样品中存在或不存在oxa-23用于确定患者的治疗方案。
73.根据权利要求1、2或12至20中任一项所述的抗体用于确定样品中存在或不存在ocl1 los的用途,任选地其中确定样品中存在或不存在ocl1 los用于确定患者的治疗方案。
74.根据权利要求1、2或21至29中任一项所述的抗体用于确定样品中存在或不存在kl49的用途,任选地其中确定样品中存在或不存在kl49用于确定患者的治疗方案。
75.根据权利要求72至74中任一项所述的用途,其中该抗体与可检测标记物缀合。
76.根据权利要求72至75中任一项所述的用途,其中该样品是从已经或怀疑已经感染鲍氏不动杆菌的人获得的。
77.根据权利要求76所述的用途,其中该样品是从已经或怀疑已经感染鲍氏不动杆菌的表现出一种或多种细菌感染症状的人获得的。
78.根据权利要求72至77中任一项所述的用途,其中该样品是血清、血浆或全血样品、口腔或鼻拭子、尿液、粪便或脑脊液(cfs),或者其中该样品来自任何疑似鲍氏不动杆菌感染的器官或组织。
79.一种诊断试剂盒,该诊断试剂盒包含根据权利要求1至35中任一项所述的抗体,以及任选地一种或多种缓冲溶液。
80.根据权利要求79所述的诊断试剂盒,其中该试剂盒包含第一试剂和第二试剂,该第一试剂包含根据权利要求1至35中任一项所述的抗体,该第二试剂包含结合该第一试剂的检测分子。
81.根据权利要求80所述的诊断试剂盒,其中该检测分子是包含可检测标记物或与该可检测标记物缀合的抗体。